记者了解到，规模较小、资质不够的基层零售店很难拿到补贴凭证，有些供种单位担心零售店乱开票，不把良补凭证发给他们。这些拿不到补贴凭证的零售店卖种时只能给农户开收据小票，供种公司、单位再以批发商、零售商的收据小票为依据来开补贴凭证，开好后的补贴凭证返回到批发店和零售店，店主再一一通知购种农民来换补贴凭证。农民拿到补贴凭证后，还须保存完好，按时逐级上交村委会、乡镇直至县里，县农业局审核没问题后，县财政再通过一卡通下发补贴款。

据了解，批发、零售店交上去的购种小票，供种单位有时候漏开。农户拿不到补贴凭证，意味着补贴款就泡汤。在牛道口镇一家农资经营店，店主拿出一叠2009年的良种补贴凭证给记者看。这些票是当年外村农民来买种子的补贴票，一直没来取，票都过期了，补贴款也就没戏了。记者粗略数了一下，这叠作废的票有30多份。同时，宝坻区种子管理站负责人也告诉记者，每年确实有一小部分农户没有领到补贴资金。记者关注些钱后来去了哪里，对方没有正面回复。