——农民负担日益严重，为控制“三提五统”费不超过上年人均纯收入的5%，实行预算制、审计制以及负担监督卡，收效甚微，增加了管理成本。

　　这一阶段中央于1998年发了关于加强农村工作若干问题的决定，提出从政治、经济、文化三方面建设社会主义村；全国人大常委会正式颁布了村民委员会组织法。这个阶段农村改革滞缓，农村经济波动较大，城乡差别拉大，“三农”问题突出。

　　第四阶段为2003年至2007年。党的十六大提出统筹城乡经济社会发展，建设现代农业，发展农村经济，增加农民收入，全面建设小康社会。党中央、国务院强调“三农”工作是全党和政府全部工作的“重中之重”，实行“工业反哺农业、城市支持农村”和“多予、少取、放活”以及改变城乡二元结构的一系列方针。自2004年起连续发了五个新的中央一号文件，包括增加农民收入、提高农业综合生产能力、建设社会主义村、发展现代农业、加强农村基础设施建设。粮食连续四年增产，农民收入有恢复性增长。

　　——在“费改税”的基础上，取消农业两税和“三提五统”费，从根本上减轻农民负担，农民增收1250亿元。

　　——农村九年义务教育免收学杂费。

　　——推行农村合作医疗制度，2006年覆盖面达到40%，2007年达到80%。

　　——实行农村最低生活保障费试点。

　　——取消对进城农民工歧视政策，维护农民工合法权益。

　　——对粮食实行直补、农机、良种、生产资料综合补贴以及最低收购价政策。

　　——加强对土地“农转非”的控制，以18亿亩为红线，将土地出让金纳入预算管理，对省级政府实行土地“农转非”指标管理。

　　——增加财政对“三农”支持力度，加强农村基础设施建设与改善生态环境建设。

　　——加强扶贫工作的力度，农村贫困人口由改革开放前的2.5亿下降为2100万。

　　——改革户籍制度试点，实行城乡居民统一户口。

　　——颁布了《农民专业合作社法》，农村专业合作社、社区股份合作社等合作组织有了新的发展。

　　这一阶段把“三农”工作纳入统筹城乡发展的大战略之中，对改变城乡二元经济社会结构以及农民的弱势地位，有了良好的开端。但是二元结构形成的两种制度安排与政策产生的矛盾日益凸显，城乡居民收入差别继续扩大，1978年为2.5:1，1984年为 1.7:1，2007年达到3.3:1。

　　总结农村经济体制改革30年的基本经验是从不自觉到自觉走上社会主义市场经济的道路，亿万农民在党的解放思想、改革开放的战略方针指引下，获得了十大创造：一是土地的家庭承包经营，成为农村市场的主体，从15年不变到30年不变到长期不变。美国著名经济学家、诺贝尔经济学奖获得者舒尔茨在考察后说，“包干到户是农村社会进步的第一推动力”。二是“异军突起”(邓小平语)的乡镇企业，改变了农村经济结构，不仅居于主导地位，而且创造了具有中国特色的工业化道路，吸纳了1亿多农业劳动力，成为国民经济的重要组成部分。一位巴基斯坦领导人说，这是中国经济腾飞的 “秘密武器”。三是民主政治建设的村民自治，开创了中国农村民主政治的先河，使农民直接行使当家作主的权利。美国前总统卡特在参观江苏吴县一个村的民主选举全过程后说，中国农民找到了行使民主权利的“诀窍”。四是进城的农民工，有1亿多农民成为工人阶级的一部分，是建筑与服务业的主力军，是中国农民的“黄埔学校”，一大批精英——农民企业家成长起来，是农村的希望。五是股份合作制。包括土地与乡镇企业，把劳动的合作与资产的合作结合起来，创造了集体产权的实现形式，使农民获得知情话语权、决策参与权、资产处置权、收益分配权、管理人员选择权等。六是农业产业化经营。延长农业的生产链，建立企业+合作组织+ 农户的利益共同体，实行种养加、供产销、农工商一体化经营，生产最终产品，提高农业的附加值。七是适度规模经营。有些地区在坚持土地集体所有和承包经营权不变的原则下，促进使用权的流转，由小农变为大农，形成农业大户——现代农业企业，提高农业劳动生产率和现代化水平。八是农业社会化服务体系。包括由政府主导农民参与的农产品市场体系、科技服务体系、产品质量标准与监测体系、环境监测体系、动植物检疫体系等，为确保农业安全提供有效保障。九是生态农业，由村——乡——县——市——省，把传统农业的精华与现代农业技术结合起来，提高农业资源的利用率，取得经济、社会、生态、文化的多种效益，创造了经济高速发展与保护生态环境统一的模式。十是走向国际。引进外资企业，提高农业的科技水平与管理水平；采取多种形式，建立农产品加工出口基地，增加出口；发展劳务输出，在国外建立生产与贸易企业，在WTO框架下，提高竞争力。