论坛上，专家们还介绍了第三代微生物肥、杀线虫生物肥、根瘤菌等前沿产品的研制和推广。山东农业大学教授周波介绍，根结线虫和胞囊线虫等植物寄生线虫是造成世界农业生产减产的重要原因之一，通过筛选克线微生物菌剂，实行生物防治最为绿色高效。中国农科院研究员周法永提出，微生物肥现已迈入第三代，目标是要实现“绿色、高产、生物防治”三效合一。

微生物肥料技术创新亮点纷呈，但面临的问题也不少。一些企业代表提出，现有一些小型菌肥类企业，由于缺少相关检测条件，无法对产品质量把关。作为一种活菌制剂，微生物肥料作用效果受施用方法、环境等多方面限制，售后技术服务跟不上，产品效果不稳定，劣质产品充斥市场，会影响推广应用。