1998年黄河流域棉区开始推广转基因抗虫棉，当年种植面积只占棉花总种植面积的5.4%；1999年以后，转基因抗虫棉种植面积迅速扩大，尤其是国产抗虫棉比重不断提高。2004年国产转基因抗虫棉品种种植面积首次超过国外品种，达到52.4%，2005年达到64.8%，2006年接近70%，2007年超过80%。

存在的问题与原因分析

目前来看，中国转基因棉花在发展中也存在一些问题。主要是构建的基因多，用于生产的少；转化的方法多，规模效率高的少；审定的品种多，种植面积有突破性的少；经营的企业多，有竞争力的少；推广的品牌多，有影响力的少。

分析起来主要是以下原因造成的：体制上，条块分割，各自为战；机制上，封闭运行，内战内行；管理上，计划色彩浓厚，政出多头；观念上，很多企业“宁做鸡头、不当凤尾”，很难做大做强。

发展的思路与对策

中国转基因棉花进一步发展的总体思路是：要全面提升技术创新与产业化能力，特别是良种的产业化能力，要以棉种龙头企业为主体，以科技创新为依托，以产权关系为纽带，以法律法规为保障，形成棉种产业化体系，培养一批能够参与国际竞争的棉种企业。

具体措施有：在技术上，选育优异品种；在营销上，培植龙头企业；在管理上，加速安全性评价并加强棉种管理；在政策上，要靠政府项目拉动，企业力量推动。