目前农药使用对生态环境的影响还没有引起足够重视。农药使用效率低、施药机械落后，农民超量、超范围使用现象相当严重，农药有效利用率不到30%，其余部分包括有毒有机溶剂和助剂经迁移转化残留于土壤、水体及大气环境中。据统计，中国每年农药的使用面积达1.67亿公顷以上，受农药严重污染的面积达0.13亿公顷，占全国耕地面积的七分之一以上，土壤的农药污染状况相当严重。

20世纪80年代中期，印度尼西亚曾爆发了一场空前的蝗灾，科学家通过实地考察，认为其根源是稻米生产中农药的大量使用（当时印度尼西亚水稻田中杀虫剂的用量占全世界的20%），致使天敌几乎完全消失。

在磺酰脲类除草剂生产过程中，尤其在原药的包装过程中，如果不严格控制粉尘和废气的排放，会对周围植物产生严重的危害，乃至于寸草不生。实际上目前国内大多数磺酰脲类农药生产企业基本没有控制措施，仅上海杜邦农化有限公司在这方面的控制较为完善。

有机氯类杀虫剂的降解速度非常慢，在干旱环境下它的半衰期可以达到几年甚至几十年。使用农药尤其是含有“三致”物质、环境累积污染物和“三废”的农药，长期后果和对生态系统的影响将会如何，到现在为止还没有明确的说法。这些问题还没有引起人们的足够重视。