腐植酸在农业生产中应用具有多方面的作用，归纳起来主要有五大作用。

(1)改良土壤作用。

各地的试验表明，将腐植酸类物质大量施入农田或连续多次施用以腐植酸类物质为主要原料配制成的肥料，不但有一定的增产效果，还具有相当好的改良土壤理化性质的作用。有关腐植酸改良土壤的研究已经很深入，其研究成果被业界所公认。

(2)化肥增效作用。

在氮、磷、钾及微量元素等化肥中添加腐植酸类物质的研究，国外进行了几十年，结果表明：腐植酸类物质对化学肥料中营养元素的有利影响，与有机肥和土壤中有机质的作用相似。总的趋势是，化肥中添加腐植酸类物质，对氮、磷、钾及微量元素均有增效作用。

(3)作物刺激作用。

腐植酸及其盐类对作物的生长发育具有刺激作用，这一特征是一般无机肥料所不具备的。一定浓度的腐植酸或其钾、钠、铵盐等通过浸种、蘸根、喷洒及根施等方式，施给大田作物或果树、蔬菜类作物，在作物的一定生长时期，可产生刺激作用，从而能够达到促进作物的生长发育、提早成熟和增产的效果。

(4)增强作物抗逆性能作用。

国外的研究早已发现，腐植酸类物质对植物生长发育和改善环境条件有重要的作用，而且这种作用在不良的外界条件下(如旱、涝、寒、热、盐碱等)效果更为明显。对这种现象专门称之为“腐植酸效应”。全国腐肥科研协作组，通过五年多的研究，在这个领域内取得了较大的进展，初步肯定了腐植酸类物质可以增强作物的抗旱、抗寒能力，对防治果树腐烂病、蔬菜霜霉病具有显著效果，某些研究结果已引起国际学术界的重视。

(5)改善农产品品质作用。

腐植酸类物质对农作物的综合效应最终体现在增加作物的产量和提高作物的品质上，特别是施用腐植酸类物质以后，能够使农作物的品质得到改善，这一特殊作用是一般化学肥料所不具备的，其效果已被国内外学者所承认。全国腐肥科研协作组几年来的多数试验研究结果表明，作物施用腐植酸，腐植酸钾、钠盐，或腐植酸氮磷，腐植酸微量元素复合肥料以后，可以使瓜果类植物果实中的糖分含量和维C含量增加，而其酸度含量随之降低，调整了果实的糖酸比度，提高了营养价值，改善了瓜果味感使之更加适口。在农业生产中推广使用腐植酸类物质，粮食作物上的增产效果和经济效益，远不如在经济作物上应用来的高。在蔬菜、瓜果、烟草等经济作物上应用，不仅取得较大的增产、增收效果，对产品的品质有较为明显的改善作用。