种子管理存在职责定位不清、多头管理、职能交叉等问题，造成管理缺位、越位、不到位，监管不力影响种子管理的权威性和执法效率。一些地方种子市场还不规范，假劣种子时有出现，对农业生产造成的安全隐患不可低估。

现阶段国家对新品种的研发投入较少，而且分散。对于一些已经具备了商业化育种基本条件的农作物，大多数企业的研发投入占销售额的比例仅为2%～3%，面向社会的公益性基础研究严重滞后，科研追求“短、平、快”项目。从应用研究看，由于投入少和育种资源分散，导致技术创新很难形成，科研上缺乏统一布局和资源的有效整合，育种项目多在低水平重复；项目缺乏明确目标，脱离生产实际需要；育繁推相互脱节，科研成果转化效率低。

企业竞争力不强。从总体上看，种子企业“多、小、散”，开发新品种和承担市场风险的能力普遍脆弱，不正当竞争问题突出。种子企业在资源、资金、人才、技术等方面的积累有限，现阶段主要通过从科研机构购买品种权或依托科研机构的产品从事经营活动，这种状况在短期内还很难改观，企业的国际竞争力不强。2006年，前10大企业的销售总额只有48亿元，仅相当于全球十强种子企业销售额的6%，只相当于孟山都一家销售额的22%。

行业组织不健全。中国种业行业组织大多挂靠在公共机构中，许多没有专职工作人员，没有独立完善的运行机制，缺乏强大的凝聚力。

种业发展趋势与展望

针对目前中国种业存在的问题，一要切实强化监管。按照《种子法》和国办《意见》要求，完善从中央到地方的种子专业执法体系，建立集中的技术支持和服务体系；依法履行种子行政许可、行政处罚、行政管理等职责，不断提高种子依法行政的效能，提高质量检验、品种保护、转基因检测、信息发布等技术支持和服务能力；真正做到管理到位、责任到位、服务到位。

二要切实强化高科技创新和产业化。在种质资源开发利用、育种技术方法、新品种培育、转基因种子研发等方面加大研究力度，加快技术产业化，提高行业整体技术水平。

三要切实增强核心竞争力。引导和扶持一批有实力、有潜力的企业做强做大，提高核心竞争力。

四要切实发挥协会的中介作用。行业协会要在推动种子产业发展中发挥重要作用，完善职能，积极维护行业利益，促进行业交流合作，推动行业自律。