中国大豆种质资源库中保存了23587份大豆地方品种资源，这些品种资源来自全国29省市。本研究从中筛选了1863份代表性材料作为核心样本来研究中国大豆种质资源的遗传多样性和遗传分化，以期为种质资源的收集保存及育种利用等研究提供信息。59个核心SSR位点在这些材料中共检测到1160个等位变异，包括97个特异等位变异和485个低频率等位变异，说明所筛选的1863份材料中具有丰富的遗传变异。利用STRUCTURE软件共将上述材料分为7个组群，这与树状进化树分析结果相一致。根据遗传分化系数Fst值，每一组群又可以划分为亚群，亚群结构与种质材料的种植区域以及生长季节等相一致。HsuM是遗传多样性最丰富的组群，这一组群中的种质来自于北纬32度至40.5度，东经105.4至122.2之间，这一区域恰好位于黄河中下游。这一结果首次从DNA分子水平验证了大豆黄河流域起源学说。分析还表明在整个群体内95.1%的等位变异存在连锁不平衡，但是组群间的分析显示连锁不平衡显著降低，这可能是由分析群体的结构不同所致，说明适宜的群体结构是连锁不平衡分析的重要因素。组群内较低的连锁不平衡也可能说明大豆在进化中发生了大量的遗传重组，而这些遗传重组在地方品种的自交后代中已经以杂合状态稳定下来。肖力伟译自TheorApplGenet(2008)