育苗期或秧田期

水稻幼苗容易受到低温、病虫害的影响，影响发芽率与幼苗素质，一般需要通过种子处理防治病虫害及生理性病害。

水稻立枯病：田间症状主要表现为出苗后秧苗枯萎，容易拔断，茎基部腐烂，有烂梨味，发病较重的整片死亡，病株基部多长有赤色霉状物。在水稻2~3叶期易发生。

苗瘟病：水稻苗瘟发生于秧苗3叶期间，主要由种子带菌引起，病株基部变黑褐色，上部呈黄褐色或淡红色而枯死。

恶苗病：病谷粒播后常不发芽或不能出土。苗期发病病苗比健苗细高，叶片叶鞘细长，叶色淡黄，根系发育不良，部分病苗在移栽前死亡。旱育秧较水育秧发病重。

稻蓟马：体长l～1.3毫米，黑褐色，头近似方形，有明显趋嫩绿稻苗产卵习性，卵散产于叶脉间。秧苗期、分蘖期和幼穗分化期，是蓟马的严重为害期，尤其是晚稻秧田和本田初期受害更重。

防治措施：针对苗期病虫害最有效最经济的方式是通过种子处理进行防治，常用的成分有噻虫嗪、咯菌腈、精甲霜灵、咪鲜胺、恶霉灵等成分。

幼苗期

幼苗期的水稻主要受杂草的危害，在水稻播种后第7~10天会有第一个出草高峰，杂草以稗草、鸭舌草为主，千金子的发生还会晚3天左右；第二出草高峰在播种后第20天左右，以阔叶杂草和莎草为主。

幼苗期的杂草防治，可以通过苗前封闭与苗后茎叶处理。

苗前封闭以30%丙草胺（加安全剂）100毫升处理，注意要在水稻催芽后播种，保证水稻有根系吸收安全剂。

苗后处理针对稗草，可以选择25克/升五氟磺草胺、4%五氟磺草胺·吡嘧磺隆、二氯喹啉酸或者双草醚，后两者注意使用时期，要在幼苗较大后施药，否则容易产生药害。前两者兼治部分阔叶杂草。

针对千金子：选择10%氰氟草酯水乳剂或者乳油剂型防治，前者更环保。

黑条矮缩病：由南方水稻黑条矮缩病毒引起，其传毒介体主要是白背飞虱。水稻发病后典型表现为植株矮缩、叶色深绿、叶背及茎秆出现条状乳白色或蜡白色，后变深褐色小突起、高位分蘖及茎节部倒生气须根、不抽穗或穗小，结实不良。剑叶或上部叶片可见凹凸的皱折，一蔸中有1根或几根稻株比健株矮1/3左右，半全穗。

水稻感病期主要在分蘖前的苗期，秧苗期和本田初期，拔节以后不易感病。最易感病期为2～6叶期。水稻苗期、分蘖前期感染发病的基本绝收。

防治方法：主要通过防治白背飞虱控制病害发生。用25%噻嗪酮、50%吡蚜酮、80%烯啶·吡蚜酮等进行防治。直播田在播种后7~10天用药。

分蘖期拔节期

纹枯病：又称云纹病。苗期至穗期都可发病。叶鞘染病在近水面处产生暗绿色水浸状边缘模糊小斑，后渐扩大呈椭圆形或云纹形，中部呈灰绿或灰褐色，湿度低时中部呈淡黄或灰白色，中部组织破坏呈半透明状，边缘暗褐。发病严重时数个病斑融合形成大病斑，呈不规则状云纹斑，常致叶片发黄枯死。

防治方法：可以选择240克/升噻呋酰胺或者30%己唑醇，或井冈蜡芽杆菌。噻呋酰胺安全性高，速度快，持效期长。

二化螟：水稻分蘖期，第一代二化螟开始危害水稻。以幼虫为害水稻，初孵幼虫群集叶鞘内为害，造成枯鞘，3龄以后幼虫蛀入稻株内为害，水稻分蘖期造成枯心苗。

防治方法：二化螟的防治注意结合农业防治技术与药剂防治。早春提早灌水翻耕，在化蛹高峰至蛾始盛期，灌水淹没稻桩3～5天，能淹死大部分老熟幼虫和蛹，减少发生基数。当枯鞘丛数达到5%~8%时，可以采用药剂防治，选择内吸性强，持效期长的产品，并配合速效性好的产品，可以到达最佳防治效果。20%氯虫苯甲酰胺建议用量10~15毫升/亩，或者10%阿维菌素·氟虫双酰胺，一般用2~3次，对于抗性强的地区需要组合杀虫单，阿维菌素，阿维菌素·毒死蜱等使用。