水稻抽穗期遇连续低温阴雨天气，应普遍用药防治稻瘟病，对易感病品种，应在破口期（全田水稻破口10%－15%）和齐穗期（全田水稻80%穗子抽出），两次用药防治。适用药剂有稻瘟灵、三环唑、咪鲜胺等。其中稻瘟灵、三环唑等药有极强的内吸传导性，一般施药后有2－3小时不下雨，防效就能得到保证。从天气预报看，近期各地多为雷阵雨天气，可以根据情况，趁雨隙喷药。雨后稻叶上有水时，宜适当减少用水量，细喷雾或者用弥雾机喷药。这样，高浓度的药液落到有水的稻叶上，能二次稀释，均匀分布到叶面，避免大量药液从叶面滑落，影响防效。
    防治稻曲病，一般应在水稻破口前1周左右施药。据江苏省农科院等单位多年前的试验研究，用井冈霉素防治稻曲病，在水稻破口前1周左右施药效果最好，到破口期再施药，几乎没有防治效果。从近几年试验示范和大面积生产用药情况看，适用于防治稻曲病的苯甲·丙环唑、戊唑醇等唑类杀菌剂，铜高尚碱式硫酸铜、琥胶肥酸铜等铜制剂以及咪鲜胺等药剂，在水稻抽穗期使用，对稻曲病也有一定的防效。水稻破口前1周没有用药防治稻曲病的田块，可以考虑在抽穗期因地制宜地选用上述药剂防治稻曲病。
    唑类杀菌剂在水稻抽穗期过量使用，特别是在遇低温阴雨水稻生长受抑制的情况下过量施药，可能影响水稻抽穗和灌浆结实，施药时应严格掌握用量，不盲目增加用量。咪鲜胺以及铜高尚碱式硫酸铜等药，对稻曲病和稻瘟病均有较好防效，正常使用对水稻的药害风险小，水稻抽穗期可以优先使用这些药剂，或者将其与其他药剂混用或交替使用。