菜田杂草综合防除指从生物和环境关系整体观点出发，本着预防为主的指导思想和安全。经济、有效、简易的原则，因地因时制宜，合理运用农业、生物、化学、物理的方法以及其他有效的生态手段，把杂草控制在不足危害的水平，以达到既可保证蔬菜增产，又不损伤人、畜健康的目的。
1、农业防除农业防除措施包括轮作灭草、精选作物种子、施用腐熟的厩肥、合理密植，以密控草、灌水淹草等。
2、机械防除机械防除是采用各种农业机械，包括手工工具和机动工具，在不同季节，采用不同方法，消灭菜田不同时期的杂草。其方法主要有深耕、少耕与免耕、苗期中耕等。
3、人工防除人工防除是最原始、最普遍的防除方法，目前在大部分菜田仍在沿用。它对于撒播的蔬菜田尤为有效，因为撒播蔬菜田不能用机械方法清除，只能靠人工耐心拔除。但这种方法工效大低，并且容易影响蔬菜的扎根。
4、生物防除利用禽、鱼灭草、以昆虫灭草、以菌灭草及植物异株克生性等生物防除技术防除杂草，既可减少除草剂对环境的污染，又有利于自然界的生态平衡，近年来已日益引起各国的重视，有些项目已大面积推广使用，取得显著效果。
5、杂草检疫杂草检疫是植物检疫的重要组成部分。它是依据国家制定的植物检疫法，防止国内外危险性杂草传播的重要手段。通过农产品检疫可以防止国外危险性的变性杂草进入我国，同时也可防止省与省之间、地区与地区之间的危险性杂草的传播，所以是杂草综合防除的重要方面。
6、化学防除 化学防除方法是利用除草剂防除杂草的方法，是目前世界上发展最快，最经济有效的方法之一。其主要优点如下：
6．1 省工 菜田化学除草，可以提高劳动生产率，减轻劳动强度，所以很受菜农的欢迎。据调查，使用化学除草技术除草，育苗韭菜田每667平方米，可节省人工除草用125～40个，胡萝卜田每667平方米可节省人工除草用工10～12个，小葱田每667平方米可节省人工除草用工15～25个。
6．2 增产 菜田使用除草剂后，由于控制了杂草危害，一般都能增产增收。据测试，在马铃薯大田，应用48％氟乐灵除草，比对照增产67.38％，利用绿麦隆除草，比对照增产57．82％，利用赛克津除草比对照增产52．81％。此外，施用除草剂后蔬菜的品质亦有不同程度的提高。
6．3 成本低 蔬菜是一种产值较高的经济作物，应用化学除草方法防除菜田杂草不但省工，并且成本较低，～般1公顷花药费75-150元，能收到1500元左右的经济效益。
6．4 间接效益十分明显由于采用化学防除方法替代传统的人工除草，可大大节省劳力，节余的劳力则可用于蔬菜的精细管理，增加蔬菜产量，或从事工、副业等其他行业，从而大大增加收入。
7、物理防除 通过覆盖，防止光的照射，抑制杂草的光合作用，造成杂草幼苗死亡或阻碍杂草种子萌发的方法是目前应用较为普遍的物理防除方法之一。利用各种塑料薄膜，包括不同颜色的色膜、涂有防草剂的药膜等覆盖菜田，不仅能控制杂草危害，并且能增温保水，是一项重要的增产措施，现正大面积推广应用。用秸秆、干草、有机肥料等材料覆盖，同样可收到一定的除草效果。
8、其它防除方法 近年来随着生物技术，特别是DNA重组技术的发展，选育抗除草剂蔬菜新品种，已成为可能，如抗赛克津等三氮苯类除草剂的甘蓝、萝卜等十字花科蔬菜已经出现，在这种田块用赛克津等三氮苯类除草剂，能杀死杂草，对蔬菜安全。