主要病害有： 
①褐斑病 
此病发生于气温特别高的7月下旬至9月中旬。病株茎表面形成许多褐色的狭长病斑，叶子变黄，继之落叶，妨碍整个植株生长发育。防治方法是喷洒波尔多液，或用代森锌喷治，使用敌菌丹可湿性粉剂800倍喷治效果也好。 
②茎枯病 
此病害茎不害叶，最易患病的部分是在距离地表30厘米左右高度的茎的表面。开始时幼茎出现乳白色的小斑点，后扩大成纺锤形的暗红色病斑，病斑布满茎枝周围高时容易发生。防治方法：定植地要排水，通风良好。要注意后期施肥，并应多施有机肥。定植时挑除病株，定植树不要过深。用0.3%-0.4%波尔多液或50%退菌特500-800倍液，或50%托布津可湿性粉剂加水1000倍，每隔7-10天喷一次，连续2-3次可治好。 
③根腐病 
此病由多种病原菌引起。病菌侵害芦笋的根部，根子腐烂时，病菌造成根的内部腐蚀而残留下的根的表皮，致使植株枯死。此病目前无特效药治，只能在栽培上注意查，一发现病株，立即将其根株掘出土烧掉。同时对受害株附近的土壤充分浇灌汞制剂消毒，不要在种过桑树、果树、马铃薯的地种芦笋。 
④立枯病 
此病的病原菌来自土壤中，发生于苗畏或功株上，植株衰弱容易染病，如采收时被刀切伤了根，也易被病菌侵入。病株距地表梢上部位变成红紫色，最后整株死亡。防治方法与根腐病相同。 
⑤锈病 
此病容易发生于冷凉地区。患病后植株茎与叶表面产生锈色病斑，叶子早期脱落，严重时会整株变色枯死。防治方法：芦笋地要选通风排水良好，选取用抗锈病品种，把病株烧毁，喷洒百菌清水溶剂和敌菌丹水溶剂。