由于疫苗的广泛使用，新城疫在世界范围内得到了较好的控制，但由低毒力新城疫病毒引起的鸡群产蛋下降、轻度呼吸道症状以及低死亡率时有发生。特别是近几年，强毒NDV引起的鸡群高死亡率和大幅度产蛋下降仍在多个国家报道。
　　由于禽流感的存在，新城疫的临床症状不再具有诊断意义，确诊必须通过病原分离。研究认为，大部分地区鸡群爆发强毒新城疫是由于鸡舍环境中存在致病力强的 NDV，特点是其F融合蛋白上有一特殊位点-113RXR/KR*F117-,并不是由低毒力转化而来的。新城疫病毒的变异问题仍然是个迷，有待进一步证实。
　　新城疫被OIE列为A类传染病，该病对世界贸易有较大的影响，因此，良好的防制措施是目前研究的热点。利用新城疫活苗和灭活苗多次进行强化免疫可有效预防新城疫的发生，但这种做法一方面增加了疫苗费用，另一方面有可能对鸡群会产生较大的应激，使其生产性能下降。疫苗免疫可以降低发病率和死亡率、减轻临床症状、减少病毒在体内环境中的数量，但疫苗免疫不能提供100%的保护，所以，要想更好地预防新城疫的发生，更应重视生物安全措施。

　　3．禽肺病毒感染（Avian pneumoviruses infection） 禽肺病毒（APV）是火鸡鼻气管炎（TRT）和鸡肺病毒感染的病原，在鸡感染后通常会发生肿头综合症（SHS）。APV先后发生于欧洲、亚洲、南美洲和中美洲，当初根据糖蛋白基因（G）的差异仅发现2个血清型A和B，1996年美国爆发了该病，然后根据基质蛋白基因（M）和融合蛋白基因（F）的差异发现了第三种血清型C，最近法国学者从鸭体内分离到了第四种血清型D。美国的APV感染最初发生于科罗拉多，后在明尼苏达州附近呈地方性流行，该地是火鸡饲养高密度区，C型APV与人的肺炎病毒A或B型较相似。
　　欧洲对APV早期的研究工作主要集中于研制该病的活疫苗和灭活疫苗，一般来讲，只要准确使用这些疫苗，效果都很好，而且两种血清型能交叉保护。APV感染鸡后继发感染败血支原体、大肠杆菌会使疾病变得很严重，另外，IBV强毒会干扰APV在气管的复制，这两种疫病的疫苗也会相互干扰，这表明了疫苗应用时机的重要性。最近美国研究表明C型APV会增强新城疫病毒对雏鸡的毒力。
　　最近研究表明，野鸟在APV的传播中起了很大的作用，可能APV与NDV和AIV一样宿主谱很广，但这仍需要进一步调查。

　　4．传染性支气管炎（Infectious bronchitis，IB） 传染性支气管炎呈世界性分布。IBV的宿主范围较窄，它广泛传播的原因与其高度的传染性及局部范围内的迅速扩散特征有关。有些毒株只在特定的国家才有。鸡群中IBV的持续存在有一些特征，但是目前这些特征的意义还不清楚。IBV主要引起呼吸道疾病，但是其它病因可以引起该病的扩散，虽然肾型毒株可以引起肾脏病变和雏鸡的死亡，但是和常规的呼吸型毒株相比，病变是局灶性的而且扩散没有那么快。
　　目前从根本上消灭IB还不可能，但是现有的疫苗可以对该病的控制提供很好的帮助。IBV S1基因氨基酸序列的差异导致了变异株的出现，这些变异株的抗原性与现有的疫苗株不同，但是偶尔也会使致病性变强而且持续存在，需要研制新的疫苗，像欧洲的793B株、4/91株和CR88株。幸运的是，不是所有的变异株都需要新疫苗，实验室传统的交叉中和试验可以阐明IBV毒株间的关系，从实用的角度说，根据中和试验得出的保护分型比血清型或基因型分型疫苗效率更有效。
　　近年来对IBV的分子结构和免疫机制有了更深的了解，这对将来控制该病很重要。例如，最近研制成功了全长的IBV感染性克隆，这种克隆可以成为一种更安全的不会返强的特定疫苗，它可以对付IBV的变异株。免疫机理研究发现，IB 的免疫并不是仅仅决定于S1基因，IBV的其它成分同样起作用，这一发现可以解释为什么一些IB疫苗可以对一些明显不同的变异株提供保护。