2007年，农业部、财政部共同启动实施了现代农业产业技术体系建设和农业行业科研专项，对农业科技项目管理进行了革命性变革，以稳定支持的方式，促进了科技与产业的紧密结合。

    50个现代农业产业技术体系涉及34个作物产品、11个畜产品、5个水产品。“十二五”期间，中央财政将每年安排13亿元经费，共设置50个产业技术研发中心，聘任1051个岗位专家，1144个综合试验站站长。

    “十一五”期间，中央财政投入农业行业科研专项经费超过35亿元，涵盖了187个项目，解决了一批限制粮食持续增产和农业稳定发展的关键共性技术问题，并在生产中大面积示范应用，推进了农业科技成果“落地生根”。

    依托现代农业产业技术体系和农业行业科研专项，农业部探索出了新的农业科技管理机制，提高了农业科技创新效率。一是建立了产业需求为导向的立项机制。在选题立项上，实行先调研，再立项。始终坚持“课题来源于生产、成果应用于实践”的科研理念。二是探索了择优委托机制。按照我国优异农业科技资源布局，在现有国家和省部级重点实验室、工程（技术）中心、改良（分）中心中择优选择项目承担单位，避免了立项环节的过度竞争。三是建立了以解决生产实际问题为主的评价考核机制。淡化奖励、论文等指标，将行业管理、技术推广等部门纳入项目验收技术用户，突出对生产的实际贡献。四是强化了跨部门、跨学科、跨区域的联合协作机制。体系和行业科研专项将优势科技资源凝聚起来，将科研力量和优势产区结合起来，围绕产业发展重大问题，实行跨部门、跨学科、跨区域的联合协作，形成支撑农业产业发展的强大科技合力。