植物锰中毒，会使根系生长受到抑制，根表皮细胞变褐色，诱发双子叶植物棉花和菜豆等发生皱叶病。
土壤中锰的供给情况主要由土壤条件决定。缺锰多发生在呈碱性、质地较轻的土壤上，主要分布在北方的小麦主产区。锰含量丰富的区域主要集中在中国南方通气不良的酸性土壤上，这些土壤有效锰含量很高，易引发植物锰中毒，因此锰肥的施用应因地制宜。
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