合理轮作。前茬以十字花科和豆科作物以及葱、蒜等蔬菜为宜，尽量避免与茄果类、瓜类等蔬菜连作，以有效阻断发病源。
 
     棚室管理。做好棚室的通风换气，调节好棚室内的温度和湿度，以控制病害发生条件，提倡小水浇灌或膜下滴灌，做好浅中耕，避免土壤板结，但不要过早过深培土。施肥以有机肥为主，增施磷、钾肥，促进根、叶稳健生长，增强植株抗性。
 
     清洁园地。发现病株要及时拔除，带出棚外集中烧毁或深埋，随即清除病穴土壤，据《农资淘宝指南》介绍喷施护树将军消毒杀菌，减少病菌在田园滋生。
 
     药剂防治。对辣椒根部病害要早发现、早防治。据《农资淘宝指南》介绍可用50％多菌灵可湿性粉剂600倍液+护树将军+根施通灌根防治，7天1次，连续3-4次，能诱导病毒集结，供护树将军靶向消毒，抑制根部病毒传导式感染及叶片和果实，保养植株输导系统健康工作。