病毒病：病毒病能通过种薯传播，是马铃薯品种退化的主要原因。病毒为害主要有两种：一是皱缩花叶；二是卷叶。防治方法：选用抗病品种及进行脱毒处理。选用无病毒种薯，田间作业时，注意尽量减少人为传播，及时喷药防治蚜虫，可用40％乐果乳剂800~1000倍液喷杀。
　　
　　 晚疫病：又称马铃薯瘟，是生产上的主要病害。病菌可浸染叶片、茎及薯块。叶片多从尖端或叶缘开始发病。病斑黑褐色，水渍状，边缘不明显，潮湿时，叶背病斑边缘上生一圈白霉，严重时植株一片焦黑，发出特殊的腐败臭味。防治方法：选用抗病品种及无病种薯，种植前进行种薯消毒，药剂（福尔马林）、温汤消毒均可。及时拔去中心病株和进行中耕除草。 
　　
　　 在当地发病前开始喷波尔多液预防。或用80％代森锌600~800倍液、75％百菌清600~800倍液防治。
　　
　　 环腐病一般在开花期前后开始表现症状，病株枝，茎缩短，叶色褪黄凋萎，叶脉间变黄，产生黑褐色斑块，叶缘略向上卷曲。防治方法：选用无病种薯，留种和切薯前彻底淘汰病薯，切块时要注意刀的消毒。发现病株时及时消除。注意防治地下害虫，实行轮作，选用抗病品种。 
　　
　　 疮痂病：疮痂病菌是一种线菌，只侵害薯块。发病初期在薯块上产生褐色圆形或不规则小点，表面粗糙，呈疮痂状硬斑，一般只在薯块皮部发病。温度高时发病较重。防治方法同环腐病。