冬枣中后期的主要病害主要是黑斑病、枣锈病、枣缩果病等；虫害以山楂叶螨、绿盲蝽、叶蝉等为主。 
　　锈病俗称枣雾，主要为害叶片，起初散生或聚生凸起的土黄色小庖，形状不规则，后期破裂，散出黄粉。在叶片对应的正面出现不规则的褪绿小斑点，后变成黄褐色角斑。最后干枯，早期脱落。发病严重时，引起早期落叶，使枣实皱缩，含糖量降低，进而削弱树势，影响产量和质量。该病每年7月中下旬发病，8～9月达到高峰，并开始落叶。7～8月份高温多雨，发病重，干旱年份发病轻；地势低洼，栽植过密，树冠郁闭的枣林发病重，地势高，通风好的发病轻。防治方法：雨季及时排水，防止潮湿过度，引致发病。根据降雨多少，于7月上旬开始喷25%金力士乳油5000～6000倍＋柔水通4000倍混合液2～3次，8月份降雨频繁，还应再喷一次25%金力士乳油5000～6000倍＋柔水通4000倍混合液2～3次，都能很好地控制病害的发展。

　　枣缩果病以为害果实为主，其症状表现的先后顺序是：晕环、水渍、着色、萎缩、脱落等。果实受害后，多在腰部出现淡黄色水渍状斑块，边缘呈浸润状，清晰。随后病斑这为暗红色，无光泽。有的病果从果梗开始产生淡褐色条纹，排列整齐。果肉呈浅褐色，组织萎缩松软，呈海绵状坏死，并逐渐向果肉深层延伸，味苦。后期病部转为暗褐色，失去光泽。病果则逐渐干缩凹陷，果皮皱缩。直到最后脱落。目前国内外对冬枣的缩果病病原物认识还不统一，有人认为是真菌所致，又有人认为是细菌所致，多数人则认为是两种病菌混合发生。目前比较认可的是，由于害虫危害或生长环境不良等导致果实出现伤口，从而诱致病害的发生。所以防治缩果病应注意虫害的预防，以及抗御异常环境如对高温干旱天气可能对果实造成日烧等机械损伤等。在用药上应注意杀虫剂与杀菌剂的配合使用，同时杀菌剂应选择既杀真菌又杀细菌的混配杀菌剂，只有这样混配使用才能发挥兼治作用。防治上应从冬枣座果后注意防治绿盲蝽等害虫的同时，每10～15天全园喷布72%农用链霉素可湿性粉剂2000～3000倍＋纳米欣可湿性粉剂1000倍，必要时再加喷4000倍柔水通，有良好的预防效果。近年来，一些对真菌和细菌兼治的杀菌剂开始上市，如进口80%金纳海水分散粒剂，应用800～1000倍可以降低防治成本。发病初期，可间隔10天左右，连喷2～3次，效果十分显著。另外合理留果，花期喷布盖利施或乳酸钙，枣园生草，减少虫伤和机械伤口也是必须的管理措施。

　　黑斑病主要为害果实。一般在枣果膨大着色时发病，受害果实先在肩部或胴部出现浅黄色不规则的变色斑，边缘较清晰，后扩大凹陷。随之变成红色褐色，后呈黑褐色，推动光泽。病部果肉为浅黄色小斑块，严重时果肉变为褐色，最后呈灰黑色或黑色。病组织松软呈海绵状坏死，味苦，不堪食用。后期害枣面出现褐色斑点，并扩大成长椭圆形病斑，果肉呈软腐状。在潮湿条件下，病部可长出许多黑色小粒点。防治方法：预防枣树衰弱和黄叶病对防治此病十分关键，生产中发现，凡事枣树树势过于衰弱或者因缺铁等生理性病害混发时，黑斑病都普遍发生严重。因此，对黄叶病可采用进口叶面肥顶绿6000倍，必要时还可选喷进口微量元素肥斯德考普6000倍，配合果友氨基酸200～300倍混合液定期叶面喷施，以矫治黄叶病，提高树势，增强抗病能力。进入果实膨大期每15～20天喷布65%普德金可湿性粉剂600～800倍＋柔水通4000倍混合液，对预防病害都有良好的预防效果。发病初期全园喷布50%鸽哈悬浮剂800～1000倍，或70%纳米欣可湿性粉剂1000倍，或70%剑力通可湿性粉剂2000～3000倍＋柔水通4000倍混合液均可有效防治。