水稻有机栽培具有改良土壤理化性质、维护水资源、环境保护、废弃物再利用及适应大众消费需求等多重意义，所以水稻有机栽培有其需要与必要性，然而有机栽培是属于高技术栽培，着重于栽培技术的认识，现将目前应用于水稻有机栽培可行的技术，分述如下，作为栽培参考。 
　　1.有机米的含义： 
　　凡在各区农业改良场规划完成的优质米适栽区内，种植改良场推荐的优质米品种，在栽培过程中不使用化学肥料、农药及生长调节剂等，且依照优质米栽培方法及干燥、碾制技术，所生产为纯的有机米。 
　　2.品种选择： 
　　水稻有机栽培依规定必须使用优质米品种。如台湾的台梗9号具有食味特优及耐贮存等优点，台中10号具有高产及食味优良等特点，均适合有机栽培，但是台梗9号较不抗稻热病及胡麻叶枯病，台中10号较不抗白叶枯病及二化螟虫，因此栽培时应特别注意病虫害的预防。 
　　3.整地作业： 
　　整地应力求平整，有利于灌排水处理，并可利用淹水防治杂草发生，整地平整亦可确保秧苗成活率，避免造成补植时成本浪费。 
　　4.有机质肥料施用技术： 
　　有机质肥料如果能够自行制造，是最符合经济成本，然而实际执行却不太容易。比较市场售价的有机质肥料，以菜籽粕、花生粕等高含氮量的植物性有机质肥料，较符合经济成本。菜籽粕是中部地区水稻有机栽培使用的主要有机质肥料，其氮：磷酐：氯化钾的比率为5.3：2.3：1.3。菜籽粕是未经腐熟的有机质肥料，因此其施用量及施用适期应特别注意。菜籽粕应用在水稻栽培，其推荐量每公顷为4,000公斤，1/2当基肥使用，约于整地前10天施用，不但可以避免插秧后，因菜籽粕发酵产生的高温对水稻生长产生危害，并可适时及适量提供水稻生长所须的营养元素；1/4作为追肥，适时适量补充水稻营养生长期间肥分的吸收，此时水稻的根系及地上部已经生长非常旺盛，不惧菜籽粕发酵产生的高温危害；1/4作为穗肥使用，一般的水稻栽培，穗肥在幼穗形成约0.2公分时施用最为适当，但施用有机质肥料因需要时间进行矿化作用，才能释放出营养成分，因此建议一期作约在幼穗形成前约8~10天，二期作约在幼穗形成前约6~8天施用最为适当。有机质肥料应避免在幼穗形成期后再施用，以免在因谷粒充实期间，有过量的氮素供应，不仅使稻株容易倒伏，亦会提高谷粒中的粗蛋白质含量，不利于稻米品质的提升。 
　　5.福寿螺防除技术： 
　　福寿螺又名金宝螺，是目前水稻生育初期的主要害虫，遍布于任何有水的地方，繁殖力非常旺盛，其危害特征是将刚插秧后的水稻嫩株，从茎杆基部剪断。如果水稻生育初期不加以防治，危害将非常严重，必须进行补植，造成生产成本浪费。目前防治的方法是使用毒性相当强的化学合成农药进行防除，虽然其效果非常好，但是因其具有高毒性，因此建议尽量避免使用。苦茶粕是使用在水稻有机栽培，防除福寿螺效果非常好的植物性废弃物，因其防治福寿螺时，同样土壤中的其它生物如水蛭、蚯蚓等亦会致死，因此施用时不宜过量，每公顷以50~100公斤为原则，水稻插秧后在田埂四周均匀撒布，即可达到防除效果。因苦茶粕防除福寿螺的效果与化学合成农药的防除效果相同，但其对人体不会构成危害，因此建议水稻栽培农户均能以苦茶粕来防除福寿螺，尽量避免使用高毒性的化学合成药剂。 
　　6.杂草防除技术： 
　　水稻以纯有机栽培，是严禁使用化学合成杀草剂。目前应用在水稻有机栽培的杂草防除技术有三种，(第一种)重复整地法：于插秧前12~15天进行第一次整地，粗耕、细耕及把平同时完成，随即给予深水(5~10公分)灌溉，持续至插秧前三天，再进行第二次整地，即可完全防除杂草。(第二种)稻壳覆盖淹水法：于插秧前力求整地平整，插秧后秧苗挺直时，每公顷覆盖约4吨稻壳，并进行淹水处理，可防除大部分的杂草，再配合人工除草，即可有效防除杂草。(第三种)高温防除法：此法是利用未经腐熟的植物性有机质肥料施用到地面，应用土壤中微生物分解有机质，在湛水情况下土壤中残存氧气，使杂草种子无法获得足够能量发芽的原理，以抑制杂草的发生，但是本项防除法，必须配合高温(例如二期作初期)，才有防治效果，一期作仅能达到初期抑制，长期则无防治效果。