甘薯三大病害是指茎线虫病、根腐病、黑斑病。这三种病害无论哪一种严重发生都能使甘薯绝产绝收，严重影响薯农的经济效益。目前生产上免疫的品种几乎没有。主要的防治方法有：
　　1、严格植物检疫。禁止从病区调运种薯、种苗。建立无病留种田繁种。选择抗病优良品种。
　　2、轮作倒茬。一般3年倒茬一次，一次倒茬不低于3年。建立无病留种田。可以和芝麻、棉花、玉米、谷子等作物轮作。不可以和葱、蒜、马铃薯倒茬。
　　4、高剪苗，剪去病根可有效预防病害发生。
　　5、药剂浸苗。用50%辛硫磷乳油或40%甲基异柳磷乳剂100倍液浸10分钟可预防茎线虫病；用50%甲基托布津可湿性粉剂500-700倍液或50%多菌灵2500-3000倍液蘸根可预防黑斑病。
　　6、田间施药。对于病地块起垄前撒施农药，或插秧时穴施，可预防病害的发生。