危害食用菌的害虫一般有昆虫、线虫、螨类及软体动物，虫害以春、秋 两季发生最重，影响食用菌的产量和品质，严重的造成绝收。因食用菌为特殊食品以及对农 药的高度敏感和选择性，加之受当前国际市场影响，各地都大力发展无公害绿色安全产品，对一些常用的农药做了严格控制。所以在栽培中，要遵循“以农业防治为主，合理配以生物物理方法，以化学防治为补救措施”的综合防治方针，充分发挥各种防治方法的优势互补，对各种食用菌的优质高产，具有非常重要的意义。具体防治方法如下：
　　 
　　(一)消灭虫害源头。在每年生产前，对菇场进行彻底清理，清除害虫孳生场所。清理范围包 括菇房、庭院。对上年所有出菇废袋、草堆垃圾、堆肥及一切有机废弃物，进行集中烧毁或 运走。并铲除杂草及脏土。于傍晚用80%敌敌畏ec(乳油，下同)15 毫升和1.8%阿维菌素(齐螨素)ec 5 毫升对水40公斤喷雾。1周后再补施1次。再过1周后用漂白粉加石灰浆粉刷菇房， 庭院普撒干石灰粉。 
　　 
　　(二)实行接种、培养、出菇3室配套。各室功能要严格分工，严禁1室多用。接种室和培养房 应远离菇房，并选择向阳、通风、干燥的房间，房屋的朝向以东西向最佳，东西两面开窗， 窗前不留遮蔽物，让阳光充分照射。接种所用的钩、筐、箩等工具也应一律专用，防止混用 ，以免携带害虫，引起传播。 
　　 
　　(三)狠抓菇前预防。食用菌栽培袋经高温消毒、接种后，移入培养房进行发菌培养。在培养 过程中易遭受虫害。由于菌丝未长满袋，因此，一旦发生虫害，很难根治，必须严防害虫侵 入菌袋内。防治方法：首先要将培养房的门窗装上纱窗，以减少害虫侵入。菌袋在移入培养房前一周用莫比朗3%ec 2毫升和1.8%阿维菌素ec 1毫升，配成2000倍液，重点对墙角、 墙脚喷雾。并关闭门窗点燃硫磺熏蒸。发菌培养期间，每隔3 天关闭门窗用灭蚊药片熏蒸。 若因预防不善，虫害侵入菌袋，可采取放药球进行杀灭。方法是：用棉花搓成蚕豆大小棉球 ，将棉球浸入乐斯本48%ec中，然后把有虫菌袋两端口打开，每端放进1颗药球，复原菌袋口 。 
　　 
　　(四)严密监测挑治。在出菇过程中，由于食用菌散发的香味，容易诱发虫害。因此，应在抓 好菇房清洁、及时采摘的基础上，严密监测，及早挑治，防止扩散。防治上应严禁使用剧毒 、高毒农药以及食用菌敏感农药。建议使用齐螨素、莫比朗、安绿宝等生物农药和低毒无残留农药。常用配方：1.8%阿维菌素ec 5 毫升和莫比朗3%10 毫升或安绿宝10%ec 10 毫升。施用方法：可采取喷雾或浸袋。喷雾对水60公斤，浸袋对水120公斤。喷雾时应将菇体摘尽， 然后再喷施。浸袋是将发生虫的菌袋放入配制的药液中，让菌袋吸足水后，立式捞起竖放， 待多余水排出后，放入出菇架上进行出菇管理。这种方法最适合出菇后期发生虫害的防治。 不仅控制了虫害，而且补充了菌袋内水分的不足。 
　　 
　　具体来说，针对不同的虫害有不同的防治方法：
　　 (一)闽菇迟眼蕈蚊(又名：尖眼菌蚊、菇蚊、菌蛆、菇蝇) 
　　 (1)搞好卫生，减少虫源，门窗安装60目纱门、纱窗。(2)灯光诱杀，可在菇房装一黑光灯或白炽灯，在灯下放一盆水，滴上几滴农药，白天开灯诱杀，晚上关灯。(3)药剂防治 可用25％澳氰菊酯1500-2000倍喷洒，在一批食用菌采收后施用，采前7天禁用。 
　　 (二)嗜菇瘿蚊(瘿蝇、小红蛆、菇蝇) 
　　 同菌蚊，也可对培养料停止喷水，使幼虫停止生殖和缺水死亡。 
　　 (三)蚤蝇(厩蝇、粪蝇、菇蛆、菇蝇) 
　　 同菌蚊，接种后关好门窗，以防成虫飞入菇房内繁殖危害。 
　　 (四)食菌大果蝇 
　　 (1)同菌蚊；(2)可在菇房悬挂敌敌畏药液布条，击到果蝇；(3)可用酒:糖:醋:水=1:2:3:4加几滴敌敌畏进行诱杀。 
　　 （五）星狄夜蛾 
　　 安装纱门纱窗，可用20％速灭杀丁或菊酯类5000—8000倍液喷杀。 
　　 （六）跳虫 
　　 防治可用0.1％的鱼藤精或1:150-200除虫菊喷洒。 
　　 (七)螨类(菌虱、红蜘蛛) 
　　 (1)菇房彻底消毒，杜绝虫源；(2)停止出菇管理，用敌敌畏密闭熏蒸菇房；(3)可用1500倍菊乐合酯喷杀。