大量玉米秸秆还田，使土壤变得疏松和空隙增大，失墒较快，种子与土壤难以紧密接触，影响种子发芽出苗，田间出苗常不整齐，容易出现缺苗断垄现象。

3、病虫危害

玉米秸秆上往往带有大量病菌和虫卵，在秸秆直接粉碎过程中无法将其杀死，还田后留在土壤里，农田病虫害特别是地下害虫有逐年加重的趋势，危害小麦正常生长。 

玉米秸秆还田，掌握以下几项配套措施，控制好关键指标,这些伤害可以避免。

1、保证秸秆粉碎质量, 掌握还田数量

调试好机械，玉米秸秆粉碎长度掌握在3-5cm为宜，以免秸秆过长土压不实，影响作物出苗和生长。