1、是操作不规范，没有专用浸种的池子，浸种浓度随意，甚至有农户在流动的溪流中浸种，或者连包装袋一起浸泡，导致种子与药液没有充分接触。效果自然很差。

2、是浸种时间不足，一般需要浸种至少四个小时以上，最好12个小时至24个小时。，部分农户只浸种两三个小时以内甚至仅仅半个小时不到。

3、是可能用了不合格的农药，比如药剂质量不达标，甚至假药。或者把拌种剂误认为是浸种剂。

4、是催芽环节有利于发病。部分农户催芽时温度过高，特别是育机插秧时秧盘集中堆放，导致催芽阶段温度偏高，病菌易侵染；部分旱育秧田覆盖薄膜导致苗床温度较高，也利于病菌侵染和病情发展。