自2010年11月起，扎旗实行住院按床日付费制度，覆盖了全部病种。旗合办将住院病人分为急危重症、非急危重症、择期手术和儿科四大类。同类疾病付费标准相同，但每日付费根据术前、术中、术后有所不同。一般来说，住院一周内付费较多，一周后则越来越少。如果病人住院超出规定天数，合就不再付费。也就是说，病人住院时间越短，治疗费用越低，医院经济收益越高。因此，只有让病人快进快出，医院才有效益。

有人曾担心：既然医保付费是固定的，医院为了增加收益，会不会让病人提前出院呢？为了防止这种现象，扎旗合办规定，如果病人一个月内因同样的疾病重复住院，合将扣除付给医院的费用。这就意味着，如果病人因出院过早导致病情反复，医院将拿不到任何补偿。

　　扎旗合办主任周丽颖说：“过去，医保部门花费了大量的精力审核病历和处方，但效率很低，效果很差。通过改革合支付方式，不但保障了广大参合农牧民的利益，而且强化了医疗机构内部医疗行为监控，刺激医疗技术和服务质量的有效提高。合床日制的改革确确实实改善了农牧民的就医难、花费高等问题。”