我国人多地少，人均农业自然资源稀缺，在二元经济结构下形成的城乡、工农关系尚有诸多深层次的矛盾还未解决，耕地和淡水资源日渐紧缺，农业基础设施脆弱，物质技术装备落后，农民扩大就业的门路不多、增收困难，城乡经济社会发展失衡、差距继续拉大等基本状况均尚未改变，农业仍然是国民经济中最薄弱的环节。因此，农业农村今后的发展仍将面临诸多压力和严峻挑战。这主要反映在以下四个方面：

　　第一，农业生产条件日渐严峻。当前和今后一个阶段，将是我国工业化、城镇化快速推进的时期，这是现代化进程的必然要求，但对农业的发展也构成了新的挑战。首先是耕地面积急剧减少。1996年，我国耕地总面积为19.51亿亩，到2005年底，已减少为18.31亿亩，9年间耕地减少1.2亿亩。而我国工业化任务尚未完成、城镇化进程尚未过半，尽管将坚持实行最严格的耕地保护制度，但耕地继续减少的趋势仍难以从根本上得到遏制，每年仅建设用地就至少需要400万亩。其次是淡水资源的短缺。2005年我国人均淡水总资源不足2200立方米，仅为世界人均水平的27%，且我国淡水资源的时空分布极不均衡，北方地区总体上严重缺水。但沿海地区的工业化、城镇化进程明显快于全国，一方面是集聚的投资多、吸引的外来就业人口多，另一方面则是减少的耕地多、粮食的生产能力下降多。以2005年与1998年相比，东南沿海10省市的粮食总产量已减少614亿斤，即减少了17.6%；其在全国粮食总产量中的比重也由34.02%降至29.67%，即下降了4.35个百分点。我国历史上长期形成的“南粮北运”格局已被“北粮南运”所替代。但问题在于，将高耗水的粮食增产交由缺水严重的北方地区来承担，其可持续性究竟如何，值得引起人们的深思。再次是近年来农田水利设施老化失修严重。至2005年底，我国耕地有效灌溉面积为8.25亿亩，占耕地总面积的45.06%，一半以上的耕地仍是靠天吃饭。在已建成的8.5万座水库中，病险水库占36%；即便是在13个粮食主产省的大中型灌区，其支渠、斗渠和农渠中的土渠还分别占80%、85%和94.6%，致使农业灌溉用水损失浪费严重，农业生产成本居高不下。

　　第二，城乡居民的收入差距仍呈继续扩大之势。改革开放以来，我国城乡居民的收入都在快速增长。但从总体趋势看，城乡居民的收入差距仍在继续扩大。1978年农民的人均纯收入为133.6元，城镇居民的人均可支配收入为343.4元，两者收入的差距比为1：2.57。改革开放之初，由于农业农村经济的快速增长，城乡收入差距曾一度明显缩小，1985年城乡居民的收入分别为739元和398元，差距之比降到了1：1.86；但由于城乡二元经济的结构尚未打破，农民增收缺乏长效机制，进入上世纪90年代以后，城乡居民的收入差距又继续拉大。2002年，城乡居民收入差距首次突破1：3，达到1：3.11；此后3年，尽管促进农民增收的政策力度不断加大，但城乡居民的收入差距始终未能缩小，2003、2004、2005这3年，城乡居民收入差距之比，分别为1：3.23、1：3.21和1：3.22。2006年，农民人均纯收入为3587元，城镇居民人均可支配收入为11759元，两者的差距又扩大为1：3.28。我国是人口大国，农村人口至今仍占大多数，这一国情固然决定了消除城乡差距的长期性，但在经济总量和财政收入快速增长的背景下，城乡居民的收入差距仍呈继续扩大之势，这显然是需要引起各方面高度关注的一大经济社会问题。

　　第三，农村的基础设施建设和教育、卫生等社会事业发展仍明显滞后。近年来，在中央一系列强有力政策措施的促进下，农村的基础设施和社会事业有了很大发展。但由于以往的欠帐太多，农村水、电、路、气等基础设施建设滞后，农村中小学教育质量低、农民缺医少药等问题仍比较突出。目前，农村还有近万个乡镇、30万个行政村未通水泥或沥青路，其中70个乡镇、近4万个行政村不通公路；约2.8亿农民的饮水不安全，2000万左右农村人口用不上电，约1.5亿农户亟需解决烧饭、取暖的燃料问题。2005年，农民平均受教育年限仅7.7年，5.04亿农村劳动力中，高中以上文化程度的只占13.68%，小学及以下文化程度的占34.10%，不识字及识字很少的还占6.87%。2005年，我国平均每千人有病床2.34张，但主要集中在城市。城市每千人有病床3.67张，农村只有0.76张；城市每张病床平均拥有8.8万元的医疗设备，农村仅有1.1万元。城乡文化事业方面的差距则更为明显。