蔬菜种子加工，就是把种子中混有未成熟的种子、菌核、虫瘿、杂草等有生命的杂质及秸秆、残叶、石子等无生命的物质，通过加工清除掉，提高种子质量，达到安全越冬，减少损失。一般包括晾晒、精选、贮藏等三个过程。
　　一、蔬菜种子的晾晒
　　入库前必须充分晾晒、降水。种子的含水量大小，是种子能否贮藏、延长使用年限的重要因素。种子如果含水量小，其本身的呼吸作用，生理活性就会受到抑制，从而使种子能够安全贮藏，增加稳定性。刚收获的种子，虽然在收割脱粒过程中也经过了晾晒，但因受时间短、阴雨天等因素影响，其含水量也不一定达到安全含水量以下，这样就需要选择几个睛朗无风的天气进行充分的晾晒，使含水量达到安全水以下。
　　一般常有风作物的含水量如下：西红柿7%-12%，白菜7%-11%，菜豆10%-12%，茄子7%-11%。种子晾晒可以采用自然干燥法，即是采摘后的种子在帘子或席子上摊开晾晒，每隔一段时间翻动一次，这样能加快水分蒸发，达到安全贮藏水分即可。
　　二、蔬菜种子的精选
　　各种蔬菜种子，在入库前必须进行精选加工，以提高种子的净度。可以采用筛选的方法，即选用适宜型号的圆孔或长孔筛子进行，清除秸秆、泥沙、瘪粒和杂质；簸箕扬即清除果皮、残叶及重量轻的干瘪种子。
　　三、蔬菜种子的贮藏
　　安全贮藏对蔬菜种子的发芽率和播种质量有着重要意义。几种蔬菜种子贮藏方法：
　　1.带荚或整枝贮藏即将收获后的蔬菜种子捆扎成把，挂在阴凉通风处，用时采摘脱粒。
　　2.袋装贮藏法把收获采摘的蔬菜种子放在牛皮纸袋或布口袋中，放置在干燥通风处，用时取出。
　　3.高吊贮藏法首先把种子晾干透后，用纱布缝成小布袋盛装。这样，加强通透性，得于种子呼吸，保证种子质量。另外，把布袋子通风、阴凉的屋顶下，不易使种子受潮、变质。
　　4.在低温、干燥、真空条件下贮藏①可放在有防腐涂料的塑料纸口袋中。
　　②密封贮藏。要选择封闭性较好的陶制坛罐，洗净晾干，内垫少量生石灰，石灰上面铺一层纸，然后把种子倒在里边，并在坛中盖个石灰包。这样，既可降低湿度，又能供应种子氧气。此方法可存放2-3年以上，其发率仍可达到95%以上。
　　5.应注意的几个问题1.要用麻袋、编织袋、布袋等包装种子，千万不能用塑料袋包装。
　　2.要放在通风干劲十足燥处存入种子，切忌入在封闭、潮湿的仓库中。地面上用砖头或者圆木等垫高30厘米以上，并要远离墙壁30厘米左右，避免潮湿使种子受损。
　　3.蔬菜种子要同农药、化肥等分开贮藏。
　　4.存放的种子要远离火炉，防止烟气熏蒸。
　　5.加强病虫防治，确保种子质量。
　　6.在室外存入的种子，要防止被雨雪淋湿。同时，注意防止鼠害及在包装袋内外挂上标记，防止混杂等。