种养结合，带来的是两个产业的融合，确实是一种创新。但是，任何一个新事物都会有受争议的一面，在虾稻综合种养模式上，也出现了一些负面的声音。

　　首先，有人对小龙虾的安全产生担忧。“田里养的小龙虾不能吃，会有化肥农药残留、重金属超标等问题”，这种观点曾经在网上激起了一层浪花。

　　中国农业大学博士高子登指出，在科学的“稻虾共作”模式中，共作期虾苗应在秧苗返青后10天左右再投放，该时期如果合理控制使用除草剂、底肥，两者对稻田水质环境的影响，理论上已经降到很低的程度。即使稻田使用杀虫剂，也应与小龙虾收获期保留1个月以上的安全期，这样对小龙虾的农药残留影响不大。在他看来，重金属超标问题与当地土壤和水资源环境关系较大，与“稻虾共作”模式关系不大。

　　周斌认为，在虾稻综合种养的过程中，只是一段时间需要进行肥水管理，需要对水质补充氮磷钾和微量元素。虾稻肥里添加了生物菌，会降解有毒害物质，促进小龙虾的健康生长。此外，小龙虾生长需要的是浮游生物，肥料只是改善其赖以生存的水质，产生更多的浮游生物。

　　其次，由于虾稻肥进入农资行业视野的时间并不长，虾稻肥的市场规范有待强化。有业内人士反馈，虾稻肥生产方面暂时没有出台国家标准，企业一般是联合农业大学及农科院所共同研制产品。

　　再者，目前市场上存在假劣虾稻肥产品，一些厂家会用普通肥料冒充虾稻专用肥，对虾稻综合种养产生危害。

　　最后，有人不禁发问：“既然稻田养虾，稻丰产、虾丰收，也能放心吃，那么，是否应该把所有的稻田都养上虾呢？”“在规模流转的土地进行稻田养虾，一方面可能造成供过于求，另一方面有损基本农田保护，也会削弱稻谷生产能力。因此，大面积推广要慎重。”中国科学院亚热带农业生态研究所研究员肖国樱解释说。高子登表示，由于小龙虾的效益是水稻的两三倍，且水稻生产过程中的田间管理措施较为复杂，假如这种模式的经营者重虾轻稻，就会致使一些地区水稻产量和品质下降，也就失去了“虾稻共作”、稳粮增效的意义。