据悉，2015年8月10日，财政部、海关总署和国家税务总局印发了《关于对化肥恢复征收增值税政策的通知》（财税〔2015〕90号），规定自2015年9月1日起，对纳税人销售和进口的化肥，统一按13%税率征收增值税，原有的增值税免税和先征后返政策相应停止执行。

按照《关于对化肥恢复征收增值税政策的通知》，从免征增值税改为征收增值税，只有按售价13%计算的增值税额的一小部分转嫁到肥料含税售价中。以尿素为例，按照出厂价(含13%税)1420元（吨价，下同）（4月17日山东地区主流出厂报价）计算，增值税销项是1420/1.13×13%=163元。不含税的出厂价就是1420-163=1257元。对于一般纳税人来说，应交增值税额是销项税减去原料、设备、运输费用等价款中所含的进项税额。假设吨尿素消耗936元的煤炭(煤炭适用17%的税率)，购进这些煤炭对应的增值税进项税额为936/1.17×17%=136元。即需要缴纳增值税24元。尿素企业可用于抵扣的进项还包括电、催化剂等动力、原料、辅料投入，以及设备投入等，购进生产资料内含的17%进项税额也可抵扣。 

若7月1日起执行新的11%增值税税率，则每吨尿素所要缴纳的增值税则降至约4元，每吨少缴19元。