石灰氮高温闷棚技术是一项全面解决设施土壤连作障碍问题的技术。由于石灰氮成本相对较高，因此该技术使用并不普遍，主要适用于种植年限较长、连作障碍严重、根结线虫病等土传性病害日趋严重的大棚或日光温室。综合考虑石灰氮的成本及防效，建议生产中每667m2使用60kg。用石灰氮消毒一般两年进行一次。

也可撒施多菌灵、百菌清可湿性粉剂等杀菌剂防治病害。每667m2可用50%多菌灵可湿性粉剂2~3kg与碳酸氢铵20~30kg混合后，均匀撒施在地上，深翻15~20cm。此外，在密闭大棚之前，棚体内表面再喷施1次多菌灵，并用10%异丙威烟剂熏蒸，以杀死躲在墙缝中的病菌和害虫。在生产上，可以将有机肥提前腐熟，均匀施入棚内，然后向粪肥和土壤表面喷施或撒施杀虫杀菌剂，施肥、施药、耕地、闷棚相结合，这样可以收到促进粪肥后熟、提高肥力、增强药效等一举多得的效果。