土壤中存在许多微生物。微生物的类群、数量与分布，由于土壤质地发育母质、发育历史、肥力、季节、作物种植状况、土壤深度和层次等等不同而有很大差异。1克肥沃土壤，如菜园土中常可含有108 个甚至更多的微生物，而在贫瘠土壤如生荒土中仅有103～107个微生物，甚至更低。土壤中的大多数微生物都是有益的，它们对土壤的作用主要有：合成土壤腐植质，增加土壤有机质，促进营养物质转化，改善土壤物理结构，促进自然界的物质循环等。

由于人类的某些农艺措施如连作及施肥不当等，病原菌逐渐成为土壤中的优势种群，在条件适宜时从作物根部或茎基部侵害作物而引起病害，这便是我们常说的土传病害。

为了防治病害，人类发明了多种化学制剂用于消灭病原菌，但绝大部分药剂在消灭病原菌的同时也消灭了土壤中的有益菌，从而造成土质退化，并造成环境的污染。

人类发现，在某些地区，有些病原菌会自然消退，这表明这些土壤中存在一种物质能减少病原菌，于是人们从这类土壤中提取筛选出了许多种土壤有益微生物，包括放线菌、真菌和细菌等，它们都具有一定的防病功能。

近来在市面上较受欢迎的微生物菌剂土康元、荧保素，其主要成分为荧光假单胞菌，它是从有着“小麦癌症”之称的小麦全蚀病退化的土壤中提取的一个菌株。该菌株主要是通过产生抗生性次级代谢产物、抗生素等生物活性物质来抑制病原菌的生长。现已证实：已产生10多种具有抗菌作用的抗生性次级代谢产物、抗生素，如羧基吩嗪、吡咯菌素、藤黄绿脓素和2,4-二乙酰基藤黄酚等。

施用了土康元的土壤，不但土传病害减少了，而且作物根系也更加发达，原来这种菌株产生的2,4-二乙酰基藤黄酚能抑制植株体内赤霉酸的生物合成和降低吲哚乙酸的含量，植株体内的脱落酸和异戊烯基腺嘌呤核苷增加，同时功能叶光合作用功能增强，根系增多，达到增加产量的效果。

利用大自然提供给我们的微生物治疗病害，不仅符合人们对绿色食品的需求，而且为农业的可持续发展提供保障，是值得推广的农业措施。