冬瓜绵疫病主要为害近成熟果实、叶和茎蔓。果实染病，先在近地面处现水渍状黄褐色病斑，后病部凹陷，其上密生白色绵絮状霉，最后病部或全果腐烂。叶片染病，病斑黄褐色，后生白霉腐烂。茎蔓染病，蔓上病斑绿色，呈湿腐状。该病多在近成熟时突然发病造成大量烂瓜、损失很大。
定植冬瓜前施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥，肥料不足的可穴施;生长期尽量少追或不追施速效氮肥，苗期适时中耕松土，以促发根和保墒，甩蔓后及时盘蔓、压蔓;生育期内尽量少浇水，遇有大暴雨后要及时排水。
发现冬瓜绵疫病病瓜及时摘除，携出田外深埋或沤肥，秋季拉秧后要注意清洁田园，及时耕翻土地。据《农资淘宝指南》介绍喷施护树大将军消毒杀菌，减少病菌传播。发病初期开始喷洒27原铜高尚悬浮剂600倍液+植物细胞免疫因子2一3次，提升植物抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡。强大免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制。此外，棚室保护地也可选用烟熏法或粉尘法，隔9天左右一次，连续防治2一3次，效果明显。