1．公牛的后裔测定方案 后裔测定是选择优良种公牛的主要手段，其主要过程为所有公牛站根据系谱或预测传递力对青年公牛进行预选，并将其精液分配到各与之合作的奶牛场，与母牛随机试配，然后根据这些公牛女儿头胎的生产性能来估算其育种值，最后根据育种值排名，确定公牛的种用价值。目前各国使用的后裔测定方案主要有3种：

　　（1）待定公牛体系（wb） 青年公牛在完成后测试配直到获得女儿头胎产奶记录以前，除保存有限数量的精液外，只是待定饲养，无论在育种群还是在生产群中均只使用经过后测选出的验证公牛。

　　（2）精液长期保存体系（ss） 青年公牛在完成后测试配后，不进行待定饲养，而是经采精获得一定数量的精液后将青年公牛全部淘汰，只冷冻保存其精液。待后测结果出来后，在育种群和生产群中均只使用经后测选出的理想公牛精液。

　　（3）青年公牛体系（yb） 未经验证的青年公牛直接在育种群和生产群中作为母牛父亲使用，但其使用年限很短，同时每头青年公牛保存有限数量的精液，待获得它们的女儿产奶记录后，选择育种值最高的青年公牛作为公牛父亲。这3种体系，前两个体系能保证公牛选择具有很高的选择强度和选择准确性，但世代间隔长，同时还因饲养待定公牛或长期保存大量精液而需较高的成本。青年公牛体系的优缺点正好与前两个体系相反。至于在一特定地区用哪一种方案，则要根据本地区的实际情况进行判定。我国目前使用的后裔测定方案是以青年公牛体系为主而兼有待定公牛体系的混合体系。青年公牛一般在未验证前就被用于生产群和育种群，同时又进行部分公牛的后裔测定。公牛父亲一般要在其女儿成绩基础上根据育种值选择。

　　2．公牛育种值的估算 当前估算公牛的育种值主要使用动物模型blup法。blup法即最优线性无偏估计法，是1973年由美国提出的一种评定种公牛育种值的方法。该方法之所以称其“最优”，是指估计值与真实值之间的方差最小，即精确度最好；所谓“无偏”是指估计值数学期望值等于真实值的期望值；所谓“线性”，说明估计育种值与观察值为线性函数关系。blup法的基础是线性混合模型，它将所有重要的系统环境影响，即随机效应和遗传分组的固定效应都加以考虑，通过混合模型方程组求解，得到最准确而又可靠的个体育种值的预测值。由于混合模型方程组的解与blup估值等价，所以在家畜实际育种中，混合模型方程组法已成为blup法的同义词。当一个混合模型中随机遗传效应为该个体本身的加性遗传值，即育种值时，该模型为个体动物模型，也称为加性遗传值模型。

　　blup法的动物模型公式为：
　　y=xb+za+e

　　式中：y――某动物的表型观察值；x――与固定效应有关的个体数矩阵；

　　b――固定效应的估计值（包括场、年、季、胎次等）；

　　z――与加性遗传效应有关的个体数矩阵；

　　a――需估计的某动物的育种值（加性遗传效应）；

　　e――随机误差。

　　该动物模型的优点如下：

　　(1)亲属资料的最佳利用，将父母、本身、旁系及后代资料有机地结合。

　　(2)可校正选配造成的配偶误差。

　　(3)当使用多泌乳期记录时，可将由淘汰造成的偏差校正到最小。

　　(4)最重要的是可校正牛群、年份、季节、性别、胎次、地区等固定环境效应并进行育种值最佳无偏估计。动物模型blup法计算过程很复杂，必须在大容量的电子计算机中，通过专用软件的运算来实现。目前在开发利用blup法软件方面已达到了通用程序化程度。