稻瘟灵、三环唑、嘧菌酯均能用于防治水稻稻瘟病，其中三环唑仅有保护作用，稻瘟灵和嘧菌酯兼有预防和治疗效果。防治水稻稻瘟病，还可以选用咪鲜胺、稻瘟酰胺、春雷霉素、肟菌酯、烯肟菌胺等药。近年来部分地区的稻瘟病病菌可能对稻瘟灵、咪鲜胺等药产生了较高抗性，导致防效下降，在这些地区宜换用其他药防治。
　　　　春雷霉素和稻瘟灵均兼有预防和治疗效果，均能用于防治稻瘟病。黑龙江省哈尔滨市农丰科技化工有限公司的41%春雷•稻瘟灵可湿性粉剂，含春雷霉素1%、稻瘟灵40%，登记用于水稻防治稻瘟病，每公顷纯药推荐用量为307.5-615克，折合每亩用制剂50-100克，折合每亩用春雷霉素纯药0.5-1克、稻瘟灵纯药20-40克。每亩用4%春雷霉素60克、40%稻瘟灵160克，用药量较大，适期施用对稻瘟病有较好防效。
　　
　　氯溴异氰尿酸是广谱杀菌剂，对危害作物的细菌、真菌、病毒具有强烈的杀灭作用，喷施在作物表面能慢慢地释放次溴酸和次氯酸，具有强烈的杀菌作用。该药对稻瘟病有一定的防效，但不专门用于防治稻瘟病，特别是不能专门用于防治穗颈瘟，以免防效不佳造成较大的产量损失。
　　　　咪鲜胺、三环唑、春雷霉素是防治稻瘟病的适用药，其中三环唑仅有保护作用，咪鲜胺和春雷霉素兼有预防和治疗作用。防治水稻穗颈瘟，主要在水稻破口期施药，水稻抽穗期遇连续低温阴雨天气，或者水稻对稻瘟病的抗性不强，应在齐穗期再用药防治一次。水稻破口初期每亩用25%咪鲜胺100克、75%三环唑20克，齐穗后7-10天每亩用25%咪鲜胺100克、2%春雷霉素200克，对穗颈瘟有较好的防治效果，仍然可以用这些药防治穗颈瘟。第二次施药时间可提前至齐穗期。