Indigo是全球非常有影响力的一家微生物领域创业公司，成立于2014年底。目前总融资金额达到15亿美金，整个业务主要是农业微生物组的开发和应用，最近几年也把数字农业和微生物农业结合在一起，解决农业的可持续发展问题。

他们在北美大概收集了4万个跟作物相关的植物内生微生物菌株，通过基因测序技术和生物信息学的方法，组建了一套人工智能的算法去预测哪些微生物对作物的生长和健康有影响，现在上市了基本上有19个商业化的产品。通过微生物技术和非转基因微生物种子处理产品，帮助农民提高作物产量，特别是小麦、棉花、玉米，分别增长13%、14%、6%，在美国干旱环境下增产可以达到30%-70%。

另外一家有代表性的微生物组公司是AgBiome，成立的时间是2012年底，主要业务是农业微生物组的开发应用。核心价值是几年内收集了北美最大的根际农业微生物菌株库2.3万株，配合其领先的筛选技术和微生物基因发掘技术，具有强大的研发能力。它们研发的菌剂产品Howler已经于近年上市，也从微生物里发现了大量可改善作物性状相关的基因。