目前，新疆已制定发布农产品自治区地方标准700多项，建设部级质检中心4个，区、县级农产品质检机构38个，互相配套，互为补充的农产品质量安全检验检测体系框架初步形成。自治区有无公害农产品认证工作机构1个，无公害农产品认证检测机构3个，绿色食品认证机构1个。

全区已创建12个国家级农业标准化示范县，86个国际级农业标准化示范区，126个自治区级农产品标准化示范区。新疆农产品质量安全管理的基本工作格局已初步形成，农产品质量安全水平明显提高。“十二五”末，新疆所有地县将完成农产品质量安全检测体系建设，并在全区逐步推行市场准入制度。