水土资源制约着兵团农业发展：水土不平衡制约着土地利用效率的提高；土壤盐碱化威胁着兵团农业生产；耕地质量下降，影响农业可持续发展；地下水资源大量超采，生态用水严重不足。兵团农业节水灌溉技术主要经历了从大水漫灌到沟畦灌、再从喷灌到膜下滴灌三个阶段。

“十一五”以来，滴灌应用的作物由棉花增加到加工番茄、玉米、小麦、甜菜、向日葵等，而且应用地域范围逐步扩大，由新疆逐步向西北、华北、东北等地推广，截至2013年底，2013年底全国节水灌溉工程面积达到4.07亿亩，滴灌面积5785万亩，占节水灌溉工程面积的14%，其中2013年滴灌面积净增945万亩；新疆（包括兵团）已推广了3800万亩，目前约有59%面积采用滴灌随水施肥技术（兵团达到95%以上）。

新疆水肥一体化大幅度提高了水资源的利用率，促进了农业增产农民增收，促进了区域水资源平衡，改善了生态环境，推动了兵团农业现代化进程，带动节水器材产业的发展和农业的社会化分工。

未来应用水肥一体化技术，希望可以在水肥一体化技术与三条线（经度、维度、海拔）相结合、与作物（品种、栽培模式、群体调控）相结合、与根系分布特征相结合、与淡盐区构造和土壤改良相适应、与排水技术相结合、与设备更新换代相结合、与农机农艺相融合以及肥料协同耦合技术等方面开展更多深入地探索，实现与经济社会效益发展相一致的最优化。