1、畸形果。番茄畸形果的类型较多，有尖顶果、空洞果、穿孔果、裂开果、双子果、菊型果、椭圆果和偏心果等多种类型。尖顶果是因为使用激素浓度过高或重复蘸药所致。穿孔果系花芽分化阶段遇到低温和光照不足造成。采用配方施肥，加强苗期管理，严格掌握激素使用浓度，并使室内有一个适宜的温、湿条件，才能减少畸形果的发生。

2、茶色果。茶色果成熟变红，但在红色果面上显露出褐色或污茶褐色，致果实发污，光泽度差，影响果实外观。属生理性病害，多在偏施氮肥，气温低的条件下发生。

3、绿背果。绿背果在变成粉红色或红色后，果肩部或果蒂附近仍残留绿色斑块或绿色区，一直不变红，看上去红绿相间，但绿色区果肉变硬，果肉酸，品质下降。主要原因是偏施氮肥、缺少钾肥及硼素，土壤干燥也是一个诱因。

4、褐筋果。褐筋果其实就是筋腐病。有褐变形和白变型2种，温室越冬茬栽培种发病较少。筋腐病系生理性病害，受害程度主要取决于品种、光照强弱及土壤中氮、磷、钾比例。温室番茄密度过大、放风量小，长期窝风也是其诱因。