辣椒猝倒病：出现少数病苗时，立即喷64％恶霜灵可湿性粉剂600倍液，75％百菌清可湿性粉剂1000倍液，72.2％霜霉威水剂600倍液，69％烯酰吗啉・锰锌可湿性粉剂800倍液等，随后可均匀撒干细土降低湿度。苗床湿度大时，不宜再喷药水，而用甲基硫菌灵或甲霜灵等粉剂拌草木灰或干细土撒于苗床上。

    辣椒立枯病：发病期可喷洒36％甲基硫菌灵悬浮剂500倍液，也可喷5％井冈霉素1500倍液等。一般每7天喷一次，连喷2～3次。当苗床同时出现猝倒病和立枯病时，可喷72.2％霜霉威水剂800倍液加50％福美双可湿性粉剂500倍液的混合液，喷药时注意喷洒茎基部及其周围地面。还可用95％恶霉灵4000倍液浇灌。

    辣椒灰霉病：棚室定植前亩用6.5％硫菌・霉威粉尘1千克喷粉，或50％多霉威可湿性粉剂600倍液喷雾灭菌；发病初期，用50％腐霉利可湿性粉剂1500～2000倍液； 50％异菌脲可湿性粉剂1000～1500倍液；或50％利得粉尘1千克／亩喷雾。7～10天一次，共2～3次，大棚还可用10％腐霉利烟熏剂，亩用药250～300克，或喷5％百菌清烟熏剂，亩用1千克。

    辣椒疫病：定植时或缓苗后，用72.2％霜霉威或64％恶霜灵可湿性粉剂500倍液浇定植穴，每株浇250毫升。发病前，喷1∶1∶200波尔多液，或58％甲霜灵锰锌可湿性粉剂400～500倍液。田间发现中心病株后，及时剪除病株、病枝，可选用50％甲霜铜可湿性粉剂500～600倍液，60％琥・乙磷铝可湿性粉剂500倍液，77％氢氧化铜可湿性粉剂500倍液，75％百菌清可湿性粉剂800倍液等喷雾，7～10天1次，连续2～3次，严重时每隔5天1次，连续3～4次。保护地栽培，除加强通风换气，还可用45％百菌清烟雾剂，每亩每次用250克，或用5％百菌清粉剂，每亩1千克，每7～10天1次，连续2～3次。

    辣椒疮痂病：发病初期用77％氢氧化铜500倍液，新植霉素4000～5000倍液，72％农用链霉素可溶性粉剂或硫酸链霉素4000倍液，47％春雷氧氯铜可湿性粉剂800倍液， 14％络氨铜水剂300倍液，50％琥胶肥酸铜400～500倍液等喷雾，7～10天一次，共2～3次，注意药剂要轮换使用。每亩用硫酸铜3～4千克撒施浇水处理土壤可以预防疮痂病。用辣椒植宝素，每包粉剂兑水15千克喷雾，有防病增产效果。

    辣椒炭疽病：田间发现病株后，选用80％的炭疽福美可湿性粉剂800倍液，或1∶1∶200波尔多液，或75％百菌清可湿性粉剂500～600倍液，或70％代森锰锌可湿性粉剂400～500倍液，或70％甲基硫菌灵可湿性粉剂600～800倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂500倍液等喷雾，7～10天1次，共3次。喷药时加入1∶800倍高产宝效果更佳。

    辣椒青枯病：发病前，预防性喷淋50％琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液，14％络氨铜水剂300倍液、0.02％硫酸链霉素加0.3％高锰酸钾，井冈霉素1000倍液，77％氢氧化铜可湿性粉剂500倍液，50％代森铵1000倍液等，7～10天1次，连续3～4次。也可用50％敌枯双可湿性粉剂800倍液、或12％松脂酸铜1000倍液灌根。每株300～500毫升，10天1次，共2～3次。

    辣椒白绢病：发病初期用敌磺钠300倍液灌蔸。植株蔸部撒石灰有一定防效。还可用50％代森铵800倍液，或25％三唑酮可湿性粉剂2000倍液，或70％代森锰锌600倍液灌根，10～15天1次，共2～3次。

    辣椒病毒病：对于棚内已经表现病毒病症状的，可喷用2％宁南霉素水剂500倍液或0.5％菇类蛋白多糖水剂200～300倍液或3.85％三氮唑核苷混宁南霉素300倍液、乙蒜素等药剂，并喷施复硝酚钠6000倍液促进辣椒生长，注意叶面补充含锌叶面肥。对于常年病毒病高发区，可采用如下的保守防治方法：盐酸吗啉胍・铜或盐酸吗啉胍400～500倍液于发病初期使用，7天1次，共3次；在2～3叶期，移栽前7天，缓苗后7天各用混合脂肪酸100倍液可增强免疫能力；定植后、初果期、盛果期早晚各用植物病毒钝化剂“912”每亩用1袋（75克）药粉，加入少量温水调成糊状，用1千克100℃开水浸泡12小时以上，充分搅拌，晾后兑水15千克；也可用菇类蛋白多糖200～300倍液，从苗期开始7天一次，共4～5次；或用菌毒清200～300倍液，发病初期7天1次，共3次。

    辣椒软腐病：可在雨前雨后及时喷洒药剂，可选用72％农用硫酸链霉素可溶性粉剂4000倍液，新植霉素4000倍液，细菌灵300倍液，百菌通500倍液，50％琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液， 77％氢氧化铜可湿性粉剂500倍液等，6～7天一次，连喷3～4次，注意药剂交替使用。