新型农村合作医疗工作在连云港市试点以来，连云港积极创新动作机制，在全国创新推出滚动筹资制度，研发信息管理系统，并逐年提高报销补偿比例，激发农民参合积极性。截至今年前三季度，连云港市共有331.31万人参合，参合率为99.81%，高出全省平均水平1个百分点。今年以来共为参合农民报销医疗费用1.86亿元。
       连云港将新型农村合作医疗工作与农村医疗卫生机构的报务质量紧密挂钩，与社区卫生服务相结合，解决了农民小病有地方看的问题，充分发挥了社区卫生服务“守门人”作用，提高了资金使用效率。同时，连云港市逐年提高筹资标准和报销比例。2008年，连云港合人均筹资由2007年的50元提高到100元，其中个人由10元提高到20元，各级财政补助由40元提高到80元，大病补偿限额也由每例4万元提高到10万元。目前，连云港四县和市区已全部建成新型农村合作医疗信息管理系统并联网，实现了网上自动审核自动报销。