据介绍，国家农作物种质资源科技创新联盟是在国家农业科技创新联盟框架下成立的专业联盟。该联盟成立后，将致力于开展农作物种质资源研究与利用，通过重大科技任务牵引、优势科研资源集聚、科学运行机制保障等手段，集聚全国农作物种质资源科研优势资源和力量，构建统一高效的农作物种质资源科技协同创新机制，促进原始创新、协同创新、管理创新和成果转化创新，实现创新驱动现代农业发展的战略目标。

我国创建了世界唯一的多维种质资源保存体系；收集、整理编目和入库保存了350多种作物47万余份种质资源，保存总量居世界第二；筛选出了一批高产优质种质和抗逆性强的种质资源，对部分特异资源进行了基因组测序与功能基因研究。近10年来，累计向国内分发、国外交换种质资源35万余份（次），为农作物育种与基础研究提供了支撑。但我国农作物资源保护、研究与利用也面临着特有种质资源消失风险加剧、优异资源和基因资源发掘利用严重滞后、种质资源保护与鉴定设施不完善、种质资源有效交流和共享不够等问题。