近年来，随着养鸡业的迅猛发展，广大养鸡专业户对疫病的防疫意识明显加强，大型养鸡企业更是制定了严格的免疫程序，但是免疫失败却时有发生，致使大量鸡群死亡，给养鸡生产造成了较大损失。 
　　1、病原的变异：病原本身时刻都在变异，但疫苗在制作、推广、使用上不可能跟上它的变异。在实际生产中，进行疫苗免疫接种后，往往免疫达不到理想的保护能力。原因之一就是抗原的变异导致病原微生物（细菌、病毒）在繁殖过程中会发生变异，在生长过程中有时使我们原来针对此病原的疫苗所产生的抗体不能够有效地杀死抗原，从而造成部分或者全部的免疫失败，如一些病原的超强毒。

　　2、母源抗体影响：由于鸡群的个体免疫应答差异以及不同批次雏鸡群不一定来自同一鸡群等原因，造成雏鸡母源抗体水平参差不齐。如果所有雏鸡固定同一日龄进行接种，若母源抗体过高会抑制疫苗的免疫反应，不产生应有的免疫应答，使雏鸡首免失败。

　　3、疫苗选择不当：鸡群在不同日龄进行不同的疫苗接种，即使同一种疫病在不同日龄需要用不同毒力的疫苗进行免疫接种，如果用苗不准确，不但起不到免疫作用，相反会造成病毒毒力增强和扩散，导致免疫失败。在疫病流行重灾区仅选取安全性高但免疫力差的疫苗就会造成鸡群免疫麻痹，影响免疫效果。另外有些病的病原含有多个血清型，如果疫苗毒株（或菌株）的血清型不同，也会造成免疫失败，针对多血清型的疾病应考虑使用多价苗。

　　4、免疫剂量不合适：疫苗稀释时如计算失误或稀释不匀会导致剂量不准确。免疫接种剂量过大，会造成免疫耐过或免疫麻痹；选用非正规厂家产品或疫病严重流行时，仍用小剂量或常规剂量免疫接种，则会造成免疫水平过低。

　　5、疫苗失效：疫苗通常有一定的有效期，过期的疫苗不能使用，使用过期疫苗不能产生理想的免疫力。另外疫苗质量不达标，如冻干疫苗封存不佳而失真空，还有疫苗制造过程中质量控制不严格，致使疫苗有效成分未达到部颁标准要求，油乳剂疫苗乳化不良而分层等，这些因素均会造成疫苗减效或失效。如果疫苗在存放和运输过程中长时间处于4℃以上的温度，或疫苗取出后在免疫接种前受到日光的直接照射，或取出时间过长，或疫苗稀释液未经消毒、受污染，或疫苗稀释后未在规定时间内用完，均可影响疫苗的效价甚至无效。

　　6、接种途径不当：每种疫苗都有特定的接种途径，不按要求进行就会引起免疫失败。因此接种途径必须正确，以恰当的方式接种适当剂量的疫苗。例如，滴鼻滴眼免疫时，疫苗未能进入眼内、鼻腔；肌注免疫时，出现“飞针”，疫苗根本没有注射进去或注入的疫苗从注射孔流出，造成疫苗注射量不足并导致疫苗污染环境。饮水免疫时，免疫前未限水或饮水器内加水量太多，使配制的疫苗未能在规定时间内饮完而影响剂量等。这些问题看起来不大，但非常重要，必须注意，否则就达不到预期的免疫效果。

　　7、免疫抑制：抑制鸡群免疫功能的因素主要有：温度鸡体对环境温度有较强的依赖性，适宜的温度环境有利于鸡体发挥正常的免疫功能。过高或过低的环境温度不仅影响鸡群的生长发育和生产性能，而且会导致免疫功能降低或造成免疫抑制，使鸡体易受到病原感染或免疫后抗体水平较低，导致免疫失败。

　　8、光照：有研究表明日光照时间超过20L∶4D（L：光照时间；D：无光照时间）时，鸡体会对抗体产生抑制作用，在24L∶0D的环境下进行免疫，免疫失败的可能性会大增。

　　9、营养因素：饲料中蛋白质等的供给及鸡体内蛋白质、氨基酸、维生素、微量元素等的代谢都对机体抗体的产生起重要的作用，营养不良与过量均影响免疫系统的发育及功能的发挥，降低免疫力，导致免疫失败。试验表明，雏鸡断水、断食48小时，法氏囊、胸腺和脾脏重量明显下降，脾脏内淋巴细胞数减少，网状内皮系统细菌清除率降低，即机体免疫能力下降。

　　10、疾病鸡群：感染马立克氏病病毒、传染性法氏囊病病毒、传染性贫血病病毒、呼肠孤病毒、霉菌毒素后会导致组织器官发生严重的病理性损伤，从而导致免疫抑制。特别是传染性法氏囊病病毒感染可以造成免疫系统的破坏，从而影响其它传染病的免疫。鸡群发病期间接种疫苗，其抗体、补体、细胞免疫的各种细胞成分与感染因子会发生严重反应，甚至引起死亡。