本病特征性的病理变化是初步诊断的依据。但其他许多微生物也可引起类似于大肠杆菌引起的病型。如病毒、支原体、葡萄球菌、沙门氏菌、念珠状链杆菌等也可引起滑膜炎—关节炎；衣原体也可引起心包炎；巴氏杆菌或链球菌有时也引起腹膜炎；支原体、衣原体等也引起气囊炎。急性败血症疾病也可由巴氏杆菌、沙门氏菌、链球菌和其他微生物引起。因此，确诊需进行病原分离与鉴定。根据病型采取不同病料，如果败血性疾病，采取血液、肝、脾等内脏实质器官；若是局限性病灶，直接采取病变组织。采取病料应尽可能在病禽濒死期或死亡不久，因死亡时间过久，肠道菌很容易侵入机体内。
　　病料直接涂片，进行革兰氏染色，典型者可见单在的革兰氏阴性小杆菌，但有时在病料中很难看到典型的细菌。
　　分离培养：如病料没有被污染，可直接用普通平板或血平板进行划线分离，如病料中细菌数量很少，可用普通肉汤增菌后，再行划线培养。如果病料污染严重，可用鉴别培养基划线分离培养后，挑取可疑菌落除涂片镜检外，作纯培养进一步鉴定。
　　种属鉴定：符合下述主要性状者可确定为大肠杆菌：形态染色，革兰氏阴性小杆菌；运动性，阳性；吲哚产生试验，阳性；柠檬酸盐利用，阴性；H2S产生试验，阴性；乳糖发酵试验阳性。
　　对于已确定的大肠埃希氏杆菌，可通过动物试验和血清型鉴定确定其病原性。在排除其他病原感染（病毒、细菌、枝原体等），经鉴定为致病血清型大肠杆菌，或动物试验有致病性者方可认为是原发性大肠杆菌病；在其他原发性疾病中分离出大肠杆菌时，应视为继发性大肠杆菌病。
禽大肠杆菌病病因错综复杂，必须采取综合性防治措施才能加以控制。
　　一般性预防措施：
（一）选好场址和病禽隔离饲养。场址应建立在地势高燥、水源充足、水质良好、排水方便、远离居民区和其他禽场，屠宰或畜产加工厂。
（二）搞好禽舍环境卫生。禽舍空气通畅，降低鸡舍内氨气等有害气体的浓度和尘埃，并定期消毒；
（三）加强饲养管理。及时淘汰处理病鸡。采精、输精严格消毒，每鸡使用一个消毒的输精管。保持营养平衡，保证饲料、垫料、饮水无污染，做好灭鼠工作。
（四）搞好其他常见病毒病的免疫，如新城疫、传染性法氏囊病、传染性支气管炎、马立克氏病等。控制好枝原体、传染性鼻炎等细菌病，建立科学的免疫程序，使鸡群保持较好的免疫水平。
（五）加强孵化厅、孵化用具的消毒卫生管理。种蛋孵化前进行熏蒸或消毒，淘汰破损明显或有粪迹污染的种蛋。
　　菌苗免疫：目前已研制出针对主要致病血清型O2；K1和O78：K80等的多价灭活菌苗。但鉴于大肠杆菌血清型较多，不同血清型抗原性不同，菌株之间缺乏完全保护，不可能针对所有养禽场流行的致病血清型，因此这种菌苗有一定的局限性。目前较为实用的方法是，在常发病的养禽场，可从本场病禽中分离致病性的大肠杆菌，选择几个有代表性的菌株制成自家（或优势菌株）多价灭活佐剂菌苗。在雏鸡7～15日龄、25～35日龄、120～140日龄各免疫一次，对减少本病的发生具有较好的效果。
　　药物防治：用于治疗本病的药物较多，如氨苄青霉素、金霉素、新霉素、庆大霉素、萘啶酸、土霉素、多粘菌素B、壮观霉素、链霉素及磺胺类药物。但禽大肠杆菌致病性菌株多，对药物敏感性不一致，经常使用一种药物会产生耐药性，尤其是对那些长时间广泛使用的药物。盲目使用药品不仅效果不佳，而且会使养殖成本增加，效益降低。因此，选择药物时必须先进行药敏试验，以免应用无效的药物。在实际用药时，尽量选择高度敏感的药物，避免同一药物连续使用，要采取“轮换”或“交替”用药方案，同时药物剂量要充足，可在发病日龄前1d～2d进行预防性投药，或发病后作紧急治疗。