塑料大棚养鸡近年来发展较快，但由于塑料大棚内特殊的环境条件，使鸡易患多种病症，在一定程度上制约着塑料大棚养鸡生产的发展和推广。
(一)感冒。塑料大棚的热量一方面来源于太阳的辐射，另一方而来源于鸡体本身散发出的生物热，加之大棚本身的“保温效应，在春、秋、冬季，白天塑料棚内完全可以满足鸡体温度的需要(18℃以上)，但是到了晚间，由于没有太阳辐射，致使棚内温度下降，特别是寒冬、早春和晚秋，塑棚内温差较大，由于昼夜温差大，如不采取保温措施，鸡体或冷或热，极易受凉感冒。
防制方法是:选用合理的大棚结构。通过通风口大小的调节及盖、卷保温草帘来调节塑棚内的温度，晚间把草帘加盖到塑料膜的表面，必要时关闭天窗和通风孔；寒冬夜间22点到凌晨4点，可采取人工加温，以保持棚内温度的稳定，缩小昼夜温差；同时查找、堵塞漏风口，避免贼风侵袭。
(二)慢性呼吸道症。空气湿度大是塑料大棚的一个主要特点，因为棚内空间小、透气性能差，加之为了保温将薄膜关闭，水蒸气难以扩散到外面。夜间、阴天，特别是温度低时，空气的相对湿度甚至处于饱和状态。在高温、高湿的环境下，鸡显得烦躁、呼吸困难，张口喘气，病原微生物大量滋生繁殖，侵袭鸡体；加之氨气、硫化氢等有害气体对呼吸道黏膜的剌激，极易诱发慢性呼吸道病症，继而发生腹水综合症等，对鸡群的危害极大。
防制方法是：除了在建塑料大棚时选择高燥地势外，平时应保持棚内干燥、通风良好。一是棚顶应设有可关闭的天窗、后墙留通风孔。白天有太阳时应打开前坡草帘，待棚内温度升高时再打开天窗和后墙的通风孔，进行排湿和排出有害的气体；夜间视棚内温度再酌情进行通风。二是棚内地面要常铺些干沙，以保持舍内干燥。
(三)啄癖症。采用塑料大棚养鸡，若不加强环境控制，鸡极易出现啄肛、啄趾、啄羽等现象。一旦形成恶癖，则很难制止，对此必须严加防制。早春、晚秋、冬季为了棚舍保温，棚子周围要严防堵死，通风不畅，棚舍内氨气、硫化氢、二氧化碳等有害气体浓度过高，会破坏鸡的生理平衡，鸡会显得烦躁不安而互啄。另外在利用塑料薄膜的温室效应提高舍温，特别是在晴朗的中午，阳光照度过高，就会造成啄食癖的产生；饲养场上卫生差，污泥积水若不及时进行清除，粘污羽毛，也可造成互癖现象；饲养密度过高也易引起互相啄食。
防制方法是：鸡舍内应当保持适宜的饲养密度，一般以在3周龄以前每平方米饲养25只，之后按15--20只的饲养密度为宜。但要按鸡群大小、强弱分开饲养。塑棚内的阳光照度过高，应采取遮阳措施加以调节，如使用遮阳网或间隙揭盖保温草帘。要注意保持环境卫生，降低舍内有害气体的含量，随时清除舍内的积水和污泥，对已患有恶食癖的鸡，要进行隔离单独饲养，对已被啄伤的鸡，其伤口上可用鱼石脂、磺胺软膏、龙胆紫、碘酊等药物进行及时消毒，均可治愈。
(四)氨中毒。塑料大棚内由于通风不良，积粪中的含氮有机物则分解成氨气，并蓄积鸡舍内，当达到一定浓度时，就会造成鸡群氨中毒。患鸡表现精神沉郁，食欲废绝，鸡冠发紫，口腔黏膜充血，眼流泪、结膜充血，部分眼脸出现水肿或角膜混浊，在临死前抽搐、麻痹。剖检可见血液稀薄而发淡，气管内充血，肺肿大变脆。
防制办法是:一旦发现鸡群中毒，应立即打开鸡舍的天窗、通风口，加强舍内通风。若出现呼吸困难、咳嗽等病症时，可用抗生素治疗；对中毒不明显的鸡只，可用1∶3000硫酸铜溶液给鸡饮水或拌料连用3天。平时要定期清除舍内的粪便，要保持鸡舍内通风良好。