稻田养鳝既要考虑黄鳝的正常栖息、生长，又要考虑水稻的营养需要及病虫害防治，因而往往容易出现一些矛盾。而解决矛盾的方法多数是以放弃一方的最佳效果而得以协调。其主要矛盾有：①排水晒田是水稻生长发育的需要，而此期间却正是黄鳝的吃食生长旺季。解决方法一般是要么放弃排水晒天，要么放干水让黄鳝放弃吃食生长的黄金时节而入洞“夏眠”。②喷洒农药是稻田养鳝者较难处理的一个矛盾。对黄鳝危害较小的药物其杀虫效果可能又不理想；杀虫效果好的又怕对黄鳝造成危害，思前顾后，往往让稻田养鳝者难于决策。③水稻生长后期，又正是黄鳝的吃食生长旺季，大量投食会使稻田肥度上升，从而导致水稻“疯长”造成倒伏减产；而减少投料又不能获得满意的黄鳝增重量。④水稻收割后，给黄鳝提供遮荫条件的水稻没有了，而此时光照仍然较强，黄鳝钻入洞中躲藏。环境的突变往往使黄鳝的采食量明显下降，从而影响黄鳝生长。