秋延后棚室番茄苗期正处在高温干旱季节，不仅病毒病易发生，其气候也利于各种害虫生殖繁衍，常见的主要有蛴螬、蝼蛄、蝗虫、美洲斑潜蝇、白粉虱、蚜虫、棉铃虫、菜青虫等。生产上应加强栽培管理，把好消毒防病关，做到综合治理病虫害，育好壮苗，为夺取丰产打下良好基础。
    一、选用抗病品种 目前较抗病的品种有毛粉802、L-402。
    二、高温闷棚灭菌 前茬作物收获后将残株杂叶及四周容易滋生病毒、蚜虫的杂草清理干净，然后对地面、墙壁、棚架喷洒一遍50%多菌灵粉剂500倍+2.5%功夫乳油1500倍+50%敌敌畏乳油800倍混合溶液，消灭各种病原菌和美洲斑潜蝇、白粉虱、蚜虫等害虫及其虫卵，之后选晴天密闭棚室进行高温闷棚2天-3天，使中午温度达到50℃-60℃，利用高温杀菌。
    三、种子消毒防病 秋延后番茄最佳播种期应选择在6月下旬至7月初，播前进行种子消毒，为防病毒病，种子先用清水浸泡4小时-5小时，然后用10%磷酸三钠溶液浸种20分钟-30分钟，捞出用清水反复冲洗干净。
    四、播种沟内灌药防虫 番茄出苗后常被蛴螬、蝼蛄咬断根茎致死，可提前采取预防措施，播种前于播种沟内浇水时顺水灌入50%辛硫磷乳油1000克/667平方米，待水渗下后播种。
    五、薄膜遮雨覆盖 播种后温室和大棚上的薄膜不要撤掉，采取薄膜遮雨覆盖，并可起到遮荫作用，降低棚内温度，减弱光照强度。出苗后保持土壤湿润，做到小水勤浇，不要因为怕徒长而不敢浇水，那样势必造成病毒病严重发生。注意加大通风量，尽量避免高温、干旱、强光环境出现。
    六、喷洒矮壮素防徒长 高温气候极易造成秧苗徒长，从而受到各种病虫害侵染的机会也相应增加。因此秧苗从2叶1心开始，每隔7天喷洒1次1000倍的矮壮素溶液，可有效防止徒长。
    七、药剂选用防治病虫 病毒病防治可喷洒1.5%植病灵水剂1000倍液或20%病毒A粉剂500倍液；蛴螬用50%辛硫磷乳油1000倍液灌根；防治蝼蛄将麦麸或玉米渣炒香，加入50%敌敌畏乳油10倍液搅拌，制成毒饵，每667平方米用量2公斤-3公斤，撒于田间；防治白粉虱喷10%扑虱灵乳油1000倍液；美洲斑潜蝇、蚜虫、棉铃虫、菜青虫等，可喷洒2.5%功夫乳油2000倍液、20%速灭杀丁乳油2000倍液、20%灭扫利乳油3000倍液、50%敌敌畏乳油1000倍液防治。发现虫害应及早防治，各种害虫混合发生时可将几种药剂混合喷洒，做到交替用药，防止害虫产生抗药性及出现药害。