目前中国施肥量、施肥方式、肥料结构的不合理成为土壤问题频发的重要因素，随着农民对生物有机肥认识的改变及市场对提高农产品品质的需要，使得生物有机肥成为土壤修复中的一大热点。南京农业大学教授黄为一表示，生物有机肥提高农产品质量作用最明显、保持土壤健康最长久，可满足农业持续发展的生态需求，资源消耗少、成本最低廉，是农业废弃物资源化有效途径。但目前生物有机肥的生产存在很多问题：菌种生产企业与肥料生产企业脱节，产品质量参差不齐，不符合科学的宣传太多；有机源收集困难，与化肥企业缺少协调发展的结合点。周法永介绍道，中国微生物肥料经历了70多年发展历程，目前已发展到第三代肥药兼效型微生物肥料，有机无机复混肥、复合微生物肥料具有广阔的应用前景。过去微生物肥料是配角，是辅助不重视，未来微生物肥料是方向，是效益的体现。但在使用时，一定要注意化肥与生物肥相结合。化肥是给农作物施肥，生物有机肥是给土壤施肥；化肥是农作物吸收的直接营养元素，微生物是通过转化提供，防病防虫效果慢。因此想要增产稳产必须与化学农药相结合，有机无机相结合是最好的途径，达到种地养地的效果。另外，生物肥并不是菌数越多越好，关键在于有效菌的定殖生存能力及其分泌代谢产物剂量，在使用时要提早使用，才能达到最好的预防效果。

　　在中国肥料领域，氮磷钾很长时间里一统天下。然而，肥料不仅包括氮磷钾，还包括锌、硼、镁、铁、硒等中微量元素和有益元素，在传统大化肥步入同质化竞争瓶颈的今天，中微肥的崛起，意味着肥料行业第二个繁荣时代的揭幕。在占中国耕地70%的中低产田中，绝大多数都存在中微量元素缺乏问题，当土壤缺乏中微量元素时，轻则减产、品质下降，重则颗粒无收，十几年的研究表明，氮磷钾目前在中国不是问题，主要的问题就是中微量元素。