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又一壮举:比人类基因组大6倍的小麦基因终于被他们搞清楚了





      2018年8月17日,美国《科学》杂志载文称世界上首个六倍体小麦基因组图谱完成。这一历时13年,来自20多个国家70多家机构的200多位科学家参与完成的这一科研成果轰动世界。国际小麦基因组测序联盟主席、澳大利亚墨尔本大学小麦育种专家Rudi Appels 评价该研究是“征服了遗传学的‘珠穆朗玛峰’!”

      宋卫宁说,就像破解人类基因密码一样,有了小麦的基因组图谱,小麦的育种、遗传研究就能向前推进一大步。这项“里程碑”工作为培育产量更高、营养更丰富、气候适应性更强的小麦品种奠定基础。

      在去年8月世界上首个六倍体小麦参考基因组发布之后,宋卫宁教授实验室没有片刻停留便又投入到新的科研工作中。据宋卫宁介绍,大多数现有的植物基因组的组装都存在许多“缝隙”(gap),获得完整的基因组仍然是一个挑战,尤其对于重复序列高、基因组庞大的复杂基因组。小麦参考基因组序列同样存在大量的gap,比如在7D染色体长臂就发现了12114个gap,总长度约5.7Mb。



      经过一年的努力,宋卫宁教授团队在小麦7DL 的组装基础上,填补了超过66%的gap序列,显著提高了小麦7DL染色体组装的完整性。并和其祖先种粗山羊草的进行了比较基因组分析,以7DL为视角揭示了小麦的驯化过程中基因组结构和序列层面的变化,为解析小麦基因组的演化及其遗传改良提供了重要的数据参考。在整个国际小麦测序联盟中,宋卫宁教授实验室是首个把基因组序列V1.0版改进为V2.0版的团队,不但填补了庞大数量的序列“缝隙”,同时还完成了深度的比较基因组分析,走在全联盟的前列。

      “7DL染色体的序列改进是小麦参考基因组V1.0后的继续和完善,可为升级版的小麦参考基因组v2.0提供参照。”据宋卫宁介绍,这将使得小麦基因组的序列注释、SNP calling、单倍型分析和全基因组关联分析等更加准确。

      “未来,我们还将继续开展序列分析工作,将小麦基因组的进化、序列与分子育种、遗传育种结合起来,培育高产、抗旱、抗盐、抗病虫的小麦新品种,更好应对全球气候变化及人口膨胀带来的食品短缺的挑战,为小麦基因组改良工作奠定基础。”宋卫宁介绍说。


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