3、缺乏价格监管，经销商哄抬利润，使农民用肥成本过高。经销商是现在有机肥市场销售的主要渠道，市场缺乏对有机肥价格的监管，使经销商的获利空间巨大，有的产品甚至能达到十倍的利润，致使农民用肥成本提高，极大降低农民使用有机肥的热情。　　

　　4、有机肥原料品种杂乱，生物质企业辅料转化慢。生物质企业辅料是很好的有机肥原料，量大、无病虫害、有机质高，但是由于市场混乱，造成好的有机质原料转化慢。目前很多有机肥生产企业使用的原料部分是利用了化工厂的废料的有效成分，这势必会给农民在使用过程中带来新的污染，降低土壤的有机质和农产品的品质。　　

　　5、有机肥鉴定监管标准过低。国家急需修改有机肥鉴定标准，仅仅用指标来衡量已经不满足现在的市场需求，有的有机肥化验指标都合格，但实际使用过程中起不到应有的功能和效果，有的甚至还造成土地减产或绝产。　　

　　对此，专家分析认为，目前有机肥所面临的的困境就是行业监管规范力度不强和农户的认可程度不够，有机肥价格较之农家肥毫无优势，农户难以从中获取效益，购买欲也就随之降低。“只有让农户降低成本增收盈利，农户才愿意加大农资投入力度，才会认可商品有机肥。”