这项研究不仅为干细胞研究带来了希望，也造成了一个古怪的新情况：反对进行胚胎干细胞研究的人士把它当做新的弹药，因为它不需要破坏胚胎。自从上个世纪90年代末科学家培育出人类胚胎干细胞以来，这项研究一直受到宗教保守人士的攻击，因为获取人类胚胎干细胞需要使用人类早期胚胎。尤其是在美国，当2001年布什总统上台之后，他宣布禁止使用联邦政府的资金资助人类胚胎干细胞研究。

　　如今，这项iPS细胞研究似乎让反对者找到了新的论据，认为胚胎干细胞研究就更加不必要了，就连布什也对该研究表示了祝贺。但是科学家认为，胚胎干细胞研究仍然需要继续。甚至汤姆逊本人也在《华盛顿邮报》上撰文指出，这项研究“改变了一切，却什么都没有改变”。威尔穆特解释说，科学家仍然需要胚胎干细胞，用于和iPS细胞做比较，而且制作和培育胚胎干细胞的方法和知识对于iPS细胞的研究也有用处。

　　距离iPS细胞真正投入临床应用可能还需要数年时间。目前iPS细胞的安全性问题还有待解决，不过它至少可以用于实验室研究。