与其他肥料配合施用通常水溶性肥料只做追肥。在推荐施肥时，应基肥与追肥结合，有机肥与无机肥结合，水溶性肥与常规肥结合。不要强调水溶性肥代替其他肥，而要配合使用，降低成本，发挥各种肥料的优势。通常基肥施用有机肥、磷肥、镁肥等，追肥用水溶性肥，少量多次施用。在发达国家水溶性肥（包括液体肥）是常规肥料，价格适宜，追肥一般全程用水溶性肥。

  　无机水溶性肥料与有机水溶性肥料配合施用现在常用的有机水溶性肥料有氨基酸、黄腐植酸、海藻多糖等。这些物质有刺激根系生长，螯合金属微量元素，提高作物抗逆性等功能。当两者配合施用会显著促进养分吸收，提高肥料利用效率。